Identification of Gene Family in Pecan (<i>Carya illinoinensis</i>) and Its Expression in Graft Healing
Notice bibliographique
Résumé
Aux/IAA (Auxin/Indole- 3- Acetic Acid) family, one of the early response gene family of auxin signals, is involved in regulating numerous aspects of plant growth and development. As an important economic plant, the identification of Aux/IAA family genes in pecan is of great significance. In this study, a total of 37 Aux/IAA family genes were identified in the pecan genome using bioinformatics method, subcellular localization revealed that all its members are located in the nucleus. Based on the phylogenic relationship with Arabidopsis Aux/IAAs gene, the 37 pecan Aux/IAA gene were categorized into two major groups (A and B). Multiple sequence alignment analysis showed that there were four typical conserved domains (I-IV) in Aux/IAA proteins of pecan. The cis-acting elements analysis revealed that all pecan Aux/IAAs had cis-acting elements in response to hormones in the promoter regions. According to the expression patterns of pecan Aux/IAA genes during graft healing, four genes with high expression were identified, which may play important roles in the formation of graft union in pecan. This study will be helpful to elucidate the function of pecan Aux/IAAs in the process of graft healing and find candidate genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».