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Enregistrement W4383958857 · doi:10.5376/mpb.2023.14.0013

Identification of Gene Family in Pecan (<i>Carya illinoinensis</i>) and Its Expression in Graft Healing

2023· article· en· W4383958857 sur OpenAlexvenueno aff
Fangren Peng, Pinghua Fan, Kaikai Zhu, Pengpeng Tan, Yongrong Ling

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePeanut Plant Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Forestry and Grassland AdministrationNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAuxinBiologyGene familyGeneArabidopsisGene expressionIndole-3-acetic acidGeneticsIdentification (biology)BotanyMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aux/IAA (Auxin/Indole- 3- Acetic Acid) family, one of the early response gene family of auxin signals, is involved in regulating numerous aspects of plant growth and development. As an important economic plant, the identification of Aux/IAA family genes in pecan is of great significance. In this study, a total of 37 Aux/IAA family genes were identified in the pecan genome using bioinformatics method, subcellular localization revealed that all its members are located in the nucleus. Based on the phylogenic relationship with Arabidopsis Aux/IAAs gene, the 37 pecan Aux/IAA gene were categorized into two major groups (A and B). Multiple sequence alignment analysis showed that there were four typical conserved domains (I-IV) in Aux/IAA proteins of pecan. The cis-acting elements analysis revealed that all pecan Aux/IAAs had cis-acting elements in response to hormones in the promoter regions. According to the expression patterns of pecan Aux/IAA genes during graft healing, four genes with high expression were identified, which may play important roles in the formation of graft union in pecan. This study will be helpful to elucidate the function of pecan Aux/IAAs in the process of graft healing and find candidate genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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