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Enregistrement W4383998635 · doi:10.1094/pdis-05-23-0900-sr

Health Status of Ready-to-Plant Grapevine Nursery Material in Canada Regarding Young Vine Decline Fungi

2023· article· en· W4383998635 sur OpenAlexaffabout
Jared Hrycan, Jane Theilmann, April Mahovlic, J. Boulé

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British ColumbiaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVineBiologyVitis viniferaBotanyHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Young vine decline (YVD), caused by several taxonomically different fungi, results in the decline and death of grapevines within a few years after planting. Infection can occur in nursery mother blocks and/or at several stages in the nursery propagation process, but the final plant material may remain asymptomatic. Four nurseries that sell ready-to-plant grapevines in Canada were sampled to evaluate the health status with regard to YVD fungi, including Botryosphaeriaceae spp., Cadophora luteo-olivacea, Dactylonectria macrodidyma, Dactylonectria torresensis, Phaeoacremonium minimum, and Phaeomoniella chlamydospora. Plants representing three cultivars, ‘Chardonnay’, ‘Merlot’, and ‘Pinot noir’, either grafted onto ‘3309C’ rootstock or self-rooted, were provided by the nurseries. Samples from the roots, base of the rootstock or self-rooted cultivar, graft-union, and scion were collected from each plant. DNA was extracted, and the total abundance of each fungus was quantified using Droplet Digital PCR. Results revealed that 99% of plants harbored at least one of the fungi studied, with a mean of three different fungal species that were present per grapevine. Droplet Digital PCR results showed that the abundance of the different fungi significantly varied between different sections of each plant, individual plants for each cultivar, and cultivars from the same nursery. Necrosis measurements were recorded from the base of the rootstock or self-rooted cultivars and did not correlate with fungal abundance recorded in that section for each grapevine, but necrosis was consistent across cultivars within nurseries. Five different rootstocks were compared from one nursery, and results showed no differences between rootstocks and their health status. Among all nurseries, C. luteo-olivacea was the most prevalent fungus (97% of the plants), while D. macrodidyma was the least commonly found (13% of the plants). This study shows that ready-to-plant nursery material sold in Canada is likely to be infected with several YVD fungi and that presence and abundance of fungi vary significantly among individual grapevines and nurseries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,516
Score d'incertitude au seuil0,829

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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