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Enregistrement W4384067607 · doi:10.1101/2023.07.11.548577

Viral infection arrests coccolithophore calcification and nutrient consumption, and triggers shifts in organic stoichiometry

2023· preprint· en· W4384067607 sur OpenAlexafffund
Tamar Dikstein, Gilad Antler, André Pellerin, Shlomit Sharoni, Miguel J. Frada

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaIsrael Science FoundationHebrew University of Jerusalem
Mots-clésEmiliania huxleyiNutrientCoccolithophoreDissolved organic carbonAlkalinityBiogeochemical cyclePhosphorusEnvironmental chemistryEcological stoichiometryRedfield ratioAlgal bloomPopulationBiologyPhytoplanktonChemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Blooms of the coccolithophore Emiliania huxleyi are routinely infected by a specific lytic virus (EhV), which rapidly kills host cells triggering bloom termination and organic and inorganic carbon export. However, the impact of EhV on the dynamic of resource acquisition and cellular stoichiometry remains unknown, limiting the current understanding of the ecological and biogeochemical significance of E. huxleyi blooms. To tackle this knowledge gap, we used algal and EhV cultures to determine over the course of infections the dynamics of alkalinity, modulated by calcification, nitrate and phosphate consumption and organic matter stoichiometry. We found that within 24hr alkalinity concentration stabilized and nutrient uptake declined to background levels. In parallel, the stoichiometric ratio of carbon to nitrogen was about 15% higher and the nitrogen to phosphorus ratio was about 12% lower during infections relative to controls. These variations likely resulted from lipid accumulation required for viral replication and the differential retention of phosphorus-rich macromolecular pools in decaying cells, respectively. Finally, after host population decay a progressive enrichment in phosphorus relative to nitrogen and carbon was detected in the remaining cell lysates. We estimate that this stoichiometric shift post-infection was driven by the progressive accumulation of heterotrophic bacteria involved in the degradation of organic material. Viral-mediated cell remodeling and consequent shifts in biomass stoichiometry likely impacts the patterns of nutrient cycling and biological carbon pump efficiency during large-scale blooms in the oceans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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