SHH PATHWAY ACTIVATION IN DEDIFFERENTIATION DURING TUMOR PROGRESSION IN MPNST
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Malignant peripheral nerve sheath tumours (MPNST) are highly aggressive sarcomas with little progress on outcomes and treatment strategies. Previous work conducted in our lab used unsupervised analyses of methylome and transcriptome profiles of 108 peripheral nerve sheath tumours to uncover two subgroups of MPNSTs that predict progression-free survival, MPNST-G1 (characterized by SHH pathway activation) and MPNST-G2 (characterized by WNT/ß-catenin/CCND1 pathway activation). Further, single nuclear RNA-sequencing revealed that MPNST-G1 and MPNST-G2 cells resemble neural crest-like and Schwann cell precursor-like cells, respectively. Purpose & Hypothesis: To examine the expression of transcription factors (TWIST1, SOX9, SNAI2, OTX2, PAX3, and PAX6) known to play canonical roles in the early neural crest cell specification in MPNST-G1 cells. We speculate that MPNST-G1 cells will display overexpression of these transcription factors compared to MPNST-G2 cells and that Sonidegib (SMO inhibitor) will revert dedifferentiation by decreasing activation of the SHH pathway. METHODS: Dedifferentiation transcription factor expression and the effects of SMO activation and inhibition in MPNST-G1 and MPNST-G2 cells were analyzed using RT-PCR and western blotting. Alamar blue and Trypan blue assays were used to determine the effect of SMO inhibition on proliferation. RESULTS: Compared to MPNST-G2 cells, MPNST-G1 cells displayed elevated expression of dedifferentiation transcription factors, SMO inhibition was able to reverse these effects. Conversely SMO activation induced the expression of these factors and induced an increase in proliferation. CONCLUSIONS: The SHH pathway activation promotes the expression of important transcription factors in dedifferentiation. This finding provides insights into the transformation process of MPNST and novel therapeutic options for these lethal cancers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».