MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4384202159 · doi:10.1038/s41419-023-05936-4

A Dhdds K42E knock-in RP59 mouse model shows inner retina pathology and defective synaptic transmission

2023· article· en· W4384202159 sur OpenAlexafffund
Mai Nguyen, Dibyendu Chakraborty, Sriganesh Ramachandra Rao, Agnieszka Onyśk, Mariusz Radkiewicz, Liliana Surmacz, Ewa Świeżewska, Eric Soubeyrand, Tariq A. Akhtar, Timothy W. Kraft, David M. Sherry, Steven J. Fliesler, Steven J. Pittler

Notice bibliographique

RevueCell Death and Disease · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNarodowe Centrum NaukiÖgonfondenNational Eye InstituteUniversity of GuelphUniversity at BuffaloKnights Templar Eye FoundationU.S. Department of Veterans AffairsU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthGovernment of Canada
Mots-clésOuter nuclear layerRetinal degenerationRetinaRetinitis pigmentosaBiologyRetinalElectroretinographyInner nuclear layerOuter plexiform layerPhotoreceptor cellCell biologyMolecular biologyNeuroscienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinitis pigmentosa (RP) defines a group of hereditary progressive rod-cone degenerations that exhibit a common phenotype caused by variants in over 70 genes. While most variants in the dehydrodolichyl diphosphate synthase (DHDDS) gene result in syndromic abnormalities, some variants cause non-syndromic RP (RP59). DHDDS encodes one subunit of the enzyme cis-prenyltransferase (CPT), which is required for the synthesis of dolichol (Dol), that is a necessary protein glycosylation cofactor. We previously reported the creation and initial characterization of a knock-in (KI) mouse model harboring the most prevalent RP59-associated DHDDS variant (K42E) to understand how defects in DHDDS lead to retina-specific pathology. This model exhibited no profound retinal degeneration, nor protein N-glycosylation defects. Here, we report that the Dol isoprenylogue species in retina, liver, and brain of the K42E mouse model are statistically shorter than in the corresponding tissues of age-matched controls, as reported in blood and urine of RP59 patients. Retinal transcriptome analysis demonstrated elevation of many genes encoding proteins involved in synaptogenesis and synaptic function. Quantitative retinal cell layer thickness measurements demonstrated a significant reduction in the inner nuclear layer (INL) and total retinal thickness (TRT) beginning at postnatal (PN) ∼2 months, progressively increasing to PN 18-mo. Histological analysis revealed cell loss in the INL, outer plexiform layer (OPL) disruption, and ectopic localization of outer nuclear layer (ONL) nuclei into the OPL of K42E mutant retinas, relative to controls. Electroretinograms (ERGs) of mutant mice exhibited reduced b-wave amplitudes beginning at PN 1-mo, progressively declining through PN 18-mo, without appreciable a-wave attenuation, relative to controls. Our results suggest that the underlying cause of DHDDS K42E variant driven RP59 retinal pathology is defective synaptic transmission from outer to inner retina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,574
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell Death and DiseaseMême sujetRetinal Development and DisordersTravaux en français237 207