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Enregistrement W4384696112 · doi:10.1101/2023.07.16.549226

Systematics of harvester ants ( <i>Messor</i> ) in Israel based on integrated morphological, genetic, and ecological data

2023· preprint· en· W4384696112 sur OpenAlexfundno aff
Maya Saar, Pierre‐André Eyer, Tali Magory Cohen, Armin Ionescu-Hirsch, Roi Dor, Netta Dorchin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect and Arachnid Ecology and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésBiologyEcologyEcological nichePhylogenetic treeEnvironmental niche modellingSubspeciesHabitatSystematicsCladeNicheEcosystem diversityTaxonomy (biology)Evolutionary biologyEcosystemGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Harvester ants of the genus Messor are considered ecosystem engineers, whose distribution is broadly influenced by a variety of environmental factors. Although distinct Messor species have been reported to inhabit different habitats, their taxonomy in Israel remains largely ambiguous, hampering the proper ecological characterization of these species. Here, we applied an integrative species delimitation approach combining morphology-based identification, phylogenetic analyses of nuclear and mitochondrial genes, and ecological niche modelling to investigate the phylogenetic relationships among Messor species in the small but ecologically diverse region of Israel. Our analyses of mitochondrial genes revealed the presence of at least 13 well-defined lineages, whereas only seven were supported by the analysis of the nuclear genes. However, the concatenated tree that included all the three markers supported 11 lineages. Among two of the lineages-in M. semirufus and in a group of ants closest in resemblance to M. grandinidus- we identified 3-4 clades that were well established on most trees, inviting further study. In addition, we reveal three undescribed species and raise two subspecies to species rank, highlighting the high diversity of harvester ants in Israel. Ecological niche modelling consistently supported the observed distribution of species, with soil type and average annual temperature being the most influential factors. These results demonstrate that species distribution modelling can serve as a valuable component of integrative species delimitation. We call for future studies to investigate these fascinating lineages of one of the most prominent and ecologically important genera of ants in the Mediterranean Basin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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