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Enregistrement W4384696308 · doi:10.1101/2023.07.17.549300

EHMT2/G9a-Inhibition Reprograms Cancer-Associated Fibroblasts (CAFs) to a More Differentiated, Less Proliferative and Invasive State

2023· preprint· en· W4384696308 sur OpenAlexafffund
Nila C. Wu, Rene Quevedo, Michelle Nurse, Kebria Hezaveh, Haijiao Liu, Fumao Sun, Julien Muffat, Yu Sun, Craig A. Simmons, Tracy L. McGaha, Panagiotis Prinos, C.H. Arrowsmith, Laurie Ailles, Elisa D’Arcangelo, Alison P. McGuigan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer CentreTed Rogers Centre for Heart ResearchUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaACanadian Institutes of Health ResearchOntario GenomicsGenome CanadaMcGill UniversityGenentechBayerPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésEpigeneticsStromal cellExtracellular matrixBiologyCancer-Associated FibroblastsCancer researchCell biologyTumor microenvironmentCancer cellCancerTumor progressionGeneticsTumor cells

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cancer-associated fibroblasts (CAFs) have previously been shown to play a pivotal role in multiple cancer dynamics, including mediating tumor cell invasion: their pro-invasive secretory profile and ability to remodel the extracellular matrix (ECM) architecture particularly promote tumor progression through tumor cell invasion into surrounding tissue areas and beyond. Given that reduced CAF abundance in tumors correlates with improved outcomes in various cancers, we set out to identify epigenetic targets involved in CAF activation in the tumor-stromal margin to reduce overall tumor aggressiveness. Using the GLAnCE (Gels for Live Analysis of Compartmentalized Environments) co-culture platform, we performed an image-based, phenotypic screen and identified EHMT2 (also known as G9a), an epigenetic enzyme that targets the methylation of histone 3 lysine 9 (H3K9), as the most potent modulator of CAF abundance and CAF-mediated tumor cell invasion. Transcriptomic and functional analysis of EHMT2-inhibited CAFs revealed the involvement of EHMT2 in driving CAFs towards a pro-invasive phenotype. Further, EHMT2 signaling mediated CAF hyperproliferation, a feature that is typically associated with activated fibroblasts present in tumors, but the molecular basis for which has not thus far been identified. This study suggests a role for EHMT2 as a regulator of CAF hyperproliferation within the tumor mass, which in turn magnifies CAF-induced pro-invasive effects on tumor cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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