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Enregistrement W4384938732 · doi:10.1016/j.jia.2023.07.023

Identification of P-type plasma membrane H+-ATPases in common wheat and characterization of TaHA7 associated with seed dormancy and germination

2023· article· en· W4384938732 sur OpenAlexaff
Bingli Jiang, Wei Gao, Yating Jiang, Shengnan Yan, Jiajia Cao, Litian Zhang, Yue Zhang, Jie Lu, Chuanxi Ma, Cheng Chang, Haiping Zhang

Notice bibliographique

RevueJournal of Integrative Agriculture · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGerminationBiologyDormancySeed dormancyGeneCommon wheatMutantSingle-nucleotide polymorphismArabidopsisCoding regionWild typeGeneticsBotanyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The P-type plasma membrane (PM) H+-ATPases (HAs) are central to plant development, growth, and defense. The HAs are thoroughly characterized in diverse plants. However, despite their importance, the functions of Has in germination and seed dormancy (SD) have not been validated in wheat. Here, we identified 28 TaHA genes (TaHA1-28) in common wheat, which were divided into five subfamilies. Examination of gene expression in strong- and weak-SD wheat varieties led to the discovery of six candidate genes (TaHA7/-12/-14/-16/-18/-20). Based on a single nucleotide polymorphism (SNP) mutation (C/T) in the TaHA7 coding region, a CAPS marker (HA7) was developed and validated in 168 wheat varieties and 171 Chinese mini-core collections exhibiting diverse germination and SD phenotypes. We further verified the roles of the two allelic variations of TaHA7 in germination and SD using wheat mutants mutagenized with ethyl methane sulphonate (EMS) in ‘Jimai 22’ and ‘Jing 411’ backgrounds, and in transgenic Arabidopsis lines. TaHA7 appears to regulate germination and SD by mediating GA and ABA signaling, metabolism, and biosynthesis. The results presented here will be beneficial for future research regarding TaHAs in wheat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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