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Enregistrement W4385069768 · doi:10.1101/2023.07.20.549870

MERTK Coordinates Efferocytosis by Regulating Integrin Localization and Activation

2023· preprint· en· W4385069768 sur OpenAlexafffund
Brandon H. Dickson, Tarannum Tasnim, Austin Le Lam, Angela Vreize, Eoin N. Blythe, Gregory A. Dekaban, Bryan Heit

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensRobarts Clinical TrialsWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMERTKEfferocytosisCell biologyIntegrinSignal transductionIntegrin alpha MBiologyGAS6ChemistryReceptor tyrosine kinaseReceptorMacrophageBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Efferocytosis – the phagocytic removal of apoptotic cells – is a central component of tissue homeostasis, and in many tissues is mediated by the efferocytic receptor MERTK expressed by macrophages. Although MERTK is critical for efferocytosis, the mechanism by which it directs the engulfment of apoptotic cells is largely unknown. Using immunoprecipitation, mass spectrometry, and super-resolution microscopy, we have identified a pre-formed receptor complex on the macrophage plasma membrane comprised of ∼180 nm clusters of MERTK, β 2 integrins, and multiple signaling molecules including Src-family kinases, PI3-kinases, and the integrin regulatory proteins ILK and FAK. MERTK is unable to mediate efferocytosis in the absence of β 2 integrins or their opsonins, while β 2 integrins require activation via MERTK signaling to induce the engulfment of apoptotic cells. Using FRET microscopy, we determined that MERTK directly induces the conformational change of β 2 integrins from the low to high-affinity form via a PI3-kinase-dependent signaling pathway. MERTK and β 2 integrins then form a highly structured synapse in which MERTK is retained by ligand-induced clustering in the synapse centre, while β 2 integrins and actin form a Src family kinase-, ILK- and FAK-dependent expanding ring which defines the leading edge of the synapse that ultimately engulfs the apoptotic cell. The identification of the MERTK membrane-proximal signaling pathway and the role of β 2 integrins in this pathway provides new insights into the function of this critical homeostatic receptor and provides new insights into how MERTK mutations and signaling defects may contribute to inflammatory and autoimmune diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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