Global population structure in an arctic-breeding bird: Diversifying and stabilizing selection consistent with local adaptation
Notice bibliographique
Résumé
Environmental variation among isolated populations can drive genetic differentiation by selection, while isolation alone results primarily in genetic drift. Genetic analyses can aid in identifying genetically isolated populations and population structure of a species across its range. Additionally, such analyses can provide indirect evidence of local adaptation through the comparison of allele frequencies at neutral and functional genetic markers, with the aim of identifying outlier loci consistent with the effects of selection. Here, we examine the genetic divergence and patterns of functional divergence among six breeding populations of arctic-breeding snow buntings (Plectrophenax nivalis). We genotyped 221 birds at 9 microsatellite markers and at 101 single nucleotide polymorphisms (SNPs) located within known-function genes. We identified substantial population differentiation using both marker types with relatively greater divergence and hence finer population structure using the microsatellite markers. While population structures resulting from the two marker types were in general agreement, functional SNPs showed evidence of stabilizing selection at both global and population pairwise levels, with a few key SNPs showing signatures of pairwise divergent selection, consistent with expectations of local adaptation. The observed complex and inconsistent pattern of pairwise divergence (selection) at key candidate-gene loci may reflect rapid environmental change decoupling locally adapted genotypes from actual local environmental conditions. Our work highlights microevolutionary changes that are likely to be very important not only in arctic-breeding songbirds, but in Arctic and Sub-Arctic vertebrates in general, which are experiencing strong environmental effects from accelerated climate change and human-induced stressors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».