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Enregistrement W4385327416 · doi:10.3389/fgene.2023.1219898

Mapping of the Cladosporium fulvum resistance gene Cf-16, a major gene involved in leaf mold disease in tomato

2023· article· en· W4385327416 sur OpenAlexaboutno aff
Dongye Zhang, Hui‐Jia Li, Guan Liu, Libo Xie, Guojun Feng, Xiangyang Xu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCladosporiumBiologyLocus (genetics)PopulationGeneGeneticsCultivarPlant disease resistanceSolanumBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tomato ( Solanum lycopersicum ) is widely cultivated and consumed worldwide. Tomato leaf mold, caused by Cladosporium fulvum , is one of the most devastating diseases in tomato production. At present, some tomato leaf mold resistance ( Cf series) genes used in production gradually lose resistance due to the continuous and rapid differentiation of C. fulvum physiological races. The Cf-16 gene derived from the “Ontario7816” tomato cultivar has shown effective resistance in field trials for many years, but few studies have reported on the mapping of the Cf-16 gene, which has not been cloned, limiting its utilization in tomato breeding. Here, we mapped Cf-16 using a novel comprehensive strategy including bulk segregation analysis (BSA), genome resequencing and SSR molecular markers. A genetic analysis revealed that Cf-16 resistance in “Ontario7816” is controlled by one major dominant locus. The Cf-16 gene was mapped in a region of 2.6 cM at chromosome 6 between two markers, namely, TGS447 and TES312, by using an F 2 population from a cross between the resistant cultivar “Ontario7816” and susceptible line “Moneymaker.” Two nucleotide-binding-site-leucine-rich repeat (NBS-LRR) resistance genes, namely, XM_004240667.3 and XM_010323727.1, were identified in this interval. They are strong candidates for the Cf-16 gene. The mapping of Cf-16 may speed up its utilization for breeding resistant tomato varieties and represents an important step forward in our understanding of the mechanism underlying resistance to tomato leaf mold.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,292
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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