The Gram-positive bacterium Romboutsia ilealis harbors a polysaccharide synthase that can produce (1,3;1,4)-β-d-glucans
Notice bibliographique
Résumé
Abstract (1,3;1,4)-β- d -Glucans are widely distributed in the cell walls of grasses (family Poaceae) and closely related families, as well as some other vascular plants. Additionally, they have been found in other organisms, including fungi, lichens, brown algae, charophycean green algae, and the bacterium Sinorhizobium meliloti . Only three members of the Cellulose Synthase-Like ( CSL ) genes in the families CSLF , CSLH , and CSLJ are implicated in (1,3;1,4)-β- d -glucan biosynthesis in grasses. Little is known about the enzymes responsible for synthesizing (1,3;1,4)-β- d -glucans outside the grasses. In the present study, we report the presence of (1,3;1,4)-β- d -glucans in the exopolysaccharides of the Gram-positive bacterium Romboutsia ilealis CRIB T . We also report that RiGT2 is the candidate gene of R. ilealis that encodes (1,3;1,4)-β- d -glucan synthase. Ri GT2 has conserved glycosyltransferase family 2 (GT2) motifs, including D, D, D, QXXRW, and a C -terminal PilZ domain that resembles the C -terminal domain of bacteria cellulose synthase, BcsA. Using a direct gain-of-function approach, we insert RiGT2 into Saccharomyces cerevisiae , and (1,3;1,4)-β- d -glucans are produced with structures similar to those of the (1,3;1,4)-β- d -glucans of the lichen Cetraria islandica . Phylogenetic analysis reveals that putative (1,3;1,4)-β- d -glucan synthase candidate genes in several other bacterial species support the finding of (1,3;1,4)-β- d -glucans in these species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».