Dissecting the cell of origin of aberrant SALL4 expression in myelodysplastic syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Dear Editor,Despite the increased reports on oncofetal protein Spalt like transcription factor 4 (SALL4) in myelodysplastic syndrome (MDS), the cellular identity of its aberrant expression in MDS patients remains unknown.Uncovering the answer to this question has important implications for furthering our understanding of the pathogenesis of F I G U R E 1 SALL4 RNA and protein were expressed in MDS bone marrow cells.(A) SALL4 expression in MDS CD34 positive cells from the public database GSE19429.(B) SALL4 expression in CD34 positive cells in MDS subtype from the public database GSE19429.RA, refractory anemia; RARS, refractory anemia with ring sideroblasts; RAEB1, refractory anemia with excess blasts1; RAEB2, refractory anemia with ring sideroblasts2.(C) MMI of SALL4 in bone marrow cells on CyTOF (MDS patients, n = 10, control BM, n = 5, error bars indicate standard deviation).Data analysis used Mann-Whitney U test.*p ≤ .05;**p ≤ .01. ns, not significant; HSPC, hematopoietic stem and progenitor cell; HSC, Hematopoietic stem cell; HPC, hematopoietic progenitor cell; MPP, multipotent progenitors, CMP; common myeloid progenitor; GMP granulocyte-monocyte progenitor; MEP, megakaryocyte-erythrocyte progenitor; NK cell, natural killer cell; MMI, median metal intensity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».