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Enregistrement W4385423647 · doi:10.1017/s0031182023000690

Comparison of Kato–Katz, PCR and coproantigen for the diagnosis of <i>Taenia solium</i> taeniasis

2023· article· en· W4385423647 sur OpenAlexfundno aff
Marshall W. Lightowlers, Diana Edithe Andria Mananjara, Mihajamanana Rakotoarinoro, Valisoa Claude Rakotoarison, Modéstine Raliniaina, Harentsoaniaina Rasamoelina-Andriamanivo, Charles G. Gauci, Abdul Jabbar, Kabemba E. Mwape, Meritxell Donadeu, Noromanana Sylvia Ramiandrasoa, José Alphonse Nely

Notice bibliographique

RevueParasitology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research CentreGlobal Affairs CanadaBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésTaenia soliumBiologyAmpliconTaeniasisPolymerase chain reactionFecesNested polymerase chain reactionTaeniaVeterinary medicineVirologyCysticercosisMicrobiologyHelminthsGeneGeneticsImmunologyCestode infectionsZoologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Four methods were compared for the diagnosis of human taeniasis caused by Taenia solium. Fecal samples from persons living in a T. solium endemic region of Madagascar were examined for taeniid eggs by the Kato–Katz method. Subsequently, samples positive (n = 16) and negative (n = 200) for T. solium eggs were examined by (i) amplification of the fragment of small subunit of the mitochondrial ribosomal RNA (rrnS) gene using conventional polymerase chain reaction (PCR) and (ii) a nested PCR of a fragment of the T. solium Tso31 gene. Additionally, 12 egg-positive and all egg-negative samples were tested for coproantigen detection. A further 9 egg-positive fecal samples were examined using both PCRs. Of the 12 egg-positive samples tested by PCRs and coproantigen methods, 9 (75%) were positive by rrnS PCR, 3 (25%) using Tso31-nested PCR and 9 (75%) by coproantigen testing. None of the 200 egg-negative fecal samples was positive in either rrnS or Tso31-nested PCR. Twenty of the 25 egg-positive samples (80%) were positive in rrnS PCR, and DNA sequencing of PCR amplicons was obtained from 18 samples, all confirmed to be T. solium. Twelve of the 25 egg-positive samples (48%) were positive in the Tso31-nested PCR, all of which were also positive by rrnS PCR. It is suggested that species-specific diagnosis of T. solium taeniasis may be achieved by either coprological examination to detect eggs or coproantigen testing, followed by rrnS PCR and DNA sequencing to confirm the tapeworm species in egg-positive or coproantigen-positive samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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