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Enregistrement W4385423647 · doi:10.1017/s0031182023000690

Comparison of Kato–Katz, PCR and coproantigen for the diagnosis of <i>Taenia solium</i> taeniasis

2023· article· en· W4385423647 sur OpenAlexfundno aff
Marshall W. Lightowlers, Diana Edithe Andria Mananjara, Mihajamanana Rakotoarinoro, Valisoa Claude Rakotoarison, Modéstine Raliniaina, Harentsoaniaina Rasamoelina-Andriamanivo, Charles G. Gauci, Abdul Jabbar, Kabemba E. Mwape, Meritxell Donadeu, Noromanana Sylvia Ramiandrasoa, José Alphonse Nely

Notice bibliographique

RevueParasitology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research CentreGlobal Affairs CanadaBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésTaenia soliumBiologyAmpliconTaeniasisPolymerase chain reactionFecesNested polymerase chain reactionTaeniaVeterinary medicineVirologyCysticercosisMicrobiologyHelminthsGeneGeneticsImmunologyCestode infectionsZoologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Four methods were compared for the diagnosis of human taeniasis caused by Taenia solium. Fecal samples from persons living in a T. solium endemic region of Madagascar were examined for taeniid eggs by the Kato–Katz method. Subsequently, samples positive ( n = 16) and negative ( n = 200) for T. solium eggs were examined by (i) amplification of the fragment of small subunit of the mitochondrial ribosomal RNA ( rrn S) gene using conventional polymerase chain reaction (PCR) and (ii) a nested PCR of a fragment of the T. solium Tso31 gene. Additionally, 12 egg-positive and all egg-negative samples were tested for coproantigen detection. A further 9 egg-positive fecal samples were examined using both PCRs. Of the 12 egg-positive samples tested by PCRs and coproantigen methods, 9 (75%) were positive by rrn S PCR, 3 (25%) using Tso31 -nested PCR and 9 (75%) by coproantigen testing. None of the 200 egg-negative fecal samples was positive in either rrn S or Tso31 -nested PCR. Twenty of the 25 egg-positive samples (80%) were positive in rrn S PCR, and DNA sequencing of PCR amplicons was obtained from 18 samples, all confirmed to be T. solium . Twelve of the 25 egg-positive samples (48%) were positive in the Tso31 -nested PCR, all of which were also positive by rrn S PCR. It is suggested that species-specific diagnosis of T. solium taeniasis may be achieved by either coprological examination to detect eggs or coproantigen testing, followed by rrn S PCR and DNA sequencing to confirm the tapeworm species in egg-positive or coproantigen-positive samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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