Comparison of Kato–Katz, PCR and coproantigen for the diagnosis of <i>Taenia solium</i> taeniasis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Four methods were compared for the diagnosis of human taeniasis caused by Taenia solium. Fecal samples from persons living in a T. solium endemic region of Madagascar were examined for taeniid eggs by the Kato–Katz method. Subsequently, samples positive (n = 16) and negative (n = 200) for T. solium eggs were examined by (i) amplification of the fragment of small subunit of the mitochondrial ribosomal RNA (rrnS) gene using conventional polymerase chain reaction (PCR) and (ii) a nested PCR of a fragment of the T. solium Tso31 gene. Additionally, 12 egg-positive and all egg-negative samples were tested for coproantigen detection. A further 9 egg-positive fecal samples were examined using both PCRs. Of the 12 egg-positive samples tested by PCRs and coproantigen methods, 9 (75%) were positive by rrnS PCR, 3 (25%) using Tso31-nested PCR and 9 (75%) by coproantigen testing. None of the 200 egg-negative fecal samples was positive in either rrnS or Tso31-nested PCR. Twenty of the 25 egg-positive samples (80%) were positive in rrnS PCR, and DNA sequencing of PCR amplicons was obtained from 18 samples, all confirmed to be T. solium. Twelve of the 25 egg-positive samples (48%) were positive in the Tso31-nested PCR, all of which were also positive by rrnS PCR. It is suggested that species-specific diagnosis of T. solium taeniasis may be achieved by either coprological examination to detect eggs or coproantigen testing, followed by rrnS PCR and DNA sequencing to confirm the tapeworm species in egg-positive or coproantigen-positive samples.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».