A Fluorogenic Disaccharide Substrate for α-Mannosidases Enables High-Throughput Screening and Identification of an Inhibitor of the GH92 Virulence Factor from <i>Streptococcus pneumoniae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Trimming of host glycans is a mechanism that is broadly employed by both commensal and pathogenic microflora to enable colonization. Host glycan trimming by the opportunistic Gram-positive bacterium Streptococcus pneumoniae has been demonstrated to be an important mechanism of virulence. While S. pneumoniae employs a multitude of glycan processing enzymes, the exo -mannosidase SpGH92 has been shown to be an important virulence factor. Accordingly, SpGH92 is hypothesized to be a target for much-needed new treatments of S. pneumoniae infection. Here we report the synthesis of 4-methylumbelliferyl α- d -mannopyranosyl-(1→2)-β- d -mannopyranoside (Manα1,2Manβ-4MU) as a fluorogenic disaccharide substrate and development of an assay for SpGH92 that overcomes its requirement for +1 binding site occupancy. We miniaturize our in vitro assay and apply it to a high-throughput screen of >65 000 compounds, identifying a single inhibitory chemotype, LIPS-343. We further show that Manα1,2Manβ-4MU is also a substrate of the human Golgi-localized α-mannosidase MAN1A1, suggesting that this substrate should be useful for assessing the activity of this and other mammalian α-mannosidases.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».