Coupled Electrostatic and Hydrophobic Destabilisation of the Gelsolin-Actin Complex Enables Facile Detection of Ovarian Cancer Biomarker Lysophosphatidic Acid
Notice bibliographique
Résumé
Lysophosphatidic acid (LPA) is a promising biomarker candidate to screen for ovarian cancer (OC) and potentially stratify and treat patients according to disease stage. LPA is known to target actin-binding protein gelsolin that is a key regulator of actin filament assembly. Previous studies have shown that the phosphate headgroup of LPA alone is inadequate to bind to the short chain of amino acids in gelsolin known as the PIP2-binding domain. Thus, the molecular-level detail of the mechanism of LPA binding is poorly understood. Here, we model LPA binding to the PIP2-binding domain of gelsolin in the gelsolin-actin complex through extensive ten microsecond atomistic molecular dynamics (MD) simulations. We predict that LPA binding causes a local conformational rearrangement due to LPA interactions with both gelsolin and actin residues. These conformational changes are a result of the amphipathic nature of LPA, where the anionic phosphate, polar glycerol and ester groups, and lipophilic aliphatic tail mediate LPA binding via charged electrostatic, hydrogen bonding, and van der Waals interactions. The negatively-charged LPA headgroup binds to the PIP2-binding domain of gelsolin-actin while its hydrophobic tail is inserted into actin, creating a strong LPA-insertion pocket that weakens the gelsolin–actin interface. The computed structure, dynamics, and energetics of the ternary gelsolin–LPA–actin complex confirms that a quantitative OC assay is possible based on LPA-triggered actin release from the gelsolin-actin complex.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».