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Enregistrement W4385578284 · doi:10.1093/noajnl/vdad070.005

BSBM-09 IN VIVO CRISPR ACTIVATION SCREEN IDENTIFIES ß-SITE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN CLEAVING ENZYME 1 (BACE1) AS A DRIVER OF NON-SMALL CELL LUNG CANCER BRAIN METASTASIS

2023· article· en· W4385578284 sur OpenAlexaff
Shawn C. Chafe, Kui Zhai, Nikoo Aghaei, Petar Miletic, Kevin R. Brown, Daniel Mobilio, Chitra Venugopal, Agata Kieliszek, Robert E. Hynds, Fred C. Lam, Jason Moffat, Charles Swanton, Shideng Bao, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRMetastasisBrain metastasisCancer researchIn vivoCancerLung cancerBiologyGeneMedicinePathologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Brain metastasis occurs in up to 40% of patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Considerable genomic heterogeneity exists between the primary lung tumour and respective brain metastasis; however, the identity of the genes capable of driving brain metastasis is incompletely understood. Here, we carried out an in vivo genome wide CRISPR activation (CRISPRa) screen to identify molecular drivers of brain metastasis from a NSCLC patient-derived xenograft model. We identified activation of the Alzheimer’s disease associated ß-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1 (BACE1) led to a significant increase in brain metastasis. BACE1 is highly expressed in NSCLC and patients with BACE1 expressed in their metastatic brain tumour survived for shorter periods. Genetic loss with CRISPR-Cas9 or pharmacological inhibition of BACE1 with MK-8931 decreased cell proliferation and sphere forming capacity in vitro. Furthermore, BACE1 knockout and MK-8931 treatment blocked brain metastasis in vivo. Mechanistically, we identified BACE1 activation lead to downstream signalling through MEK and ERK. Together our data highlights the power of in vivo CRISPR screening to identify novel molecular drivers and potential therapeutic targets of NSCLC brain metastasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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