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Enregistrement W4385578338 · doi:10.1093/noajnl/vdad070.004

BSBM-07 HIGH-DIMENSIONAL HISTOPATHOLOGIC EVALUATION OF THE HYPOXIC MICROENVIRONMENT IN GLIOBLASTOMA

2023· article· en· W4385578338 sur OpenAlexaff
Sheila Mansouri, Mark Zaidi, Olivia Singh, Shirin Karimi, Phoebe Lombard, Anna Dvorkin‐Gheva, Carlos Velásquez, Hafsah Ali, Kaviya Devaraja, Julio Sosa, Vikas Patil, Qingxia Wei, Ronald Wu, Mira Li, May Cheung, Mathew Voisin, Andrew Gao, David W. Hedley, Kenneth Aldape, Bradly G. Wouters, Gelareh Zadeh, Shreya Gandhi

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity Health NetworkMcMaster University Medical CentreUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypoxia (environmental)PathologyBiologyAngiogenesisImmunohistochemistryCell typeMass cytometryCellTumor microenvironmentCancer researchTumour heterogeneityPhenotypeMedicineChemistryCancerTumor cellsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rapidly growing solid tumors such as glioblastoma (GBM) are characteristically hypoxic, displaying large areas of necrosis surrounded by hyperproliferative pseudopalisading cells. Intra-tumoral hypoxia develops over time in the three-dimensional space and the degree of tissue oxygenation is a dynamic process that varies continuously. Combined with the extensive inter- and intra-tumoral heterogeneity associated with GBM at the bulk and single cell level, hypoxia contributes to a gradient of molecular alterations that are specific to the different cell populations that make up the bulk of the tumor and reside in specific niches. To date, high dimensional histopathologic analyses of the hypoxic regions within GBM tissue have not been performed. Here, we took a combined spatial and single-cell proteomic profiling approach to investigate the histopathologic features of hypoxia by leveraging a unique clinical study where the exogenous hypoxia marker pimonidazole (PIMO) is administered to patients with GBM prior to surgery. Tissue specimens were subjected to imaging mass cytometry and serial immunohistochemistry using a panel of 27 markers associated with cellular hallmarks of hypoxia, metabolism, proliferation, stemness, angiogenesis, and immune cell types. We took high-resolution imaging and statistical approaches to explore the interplay of the different markers within hypoxic regions of primary and recurrent GBMs, in addition to IDH-mutant gliomas. Our findings elucidate the expression pattern of key biological markers relative to one another, altered composition of different cell types, along with differential proliferative, transcriptional, and translational activation states associated with each cell type within the hypoxic regions of GBM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,215
Score d'incertitude au seuil0,316

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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