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Enregistrement W4385584393 · doi:10.1093/noajnl/vdad070.130

SYST-28 FUNCTIONAL MAPPING REVEALS WIDESPREAD REMODELLING AND A NOVEL TARGETABLE PTP4A2-ROBO1 SIGNALING AXIS AT GLIOBLASTOMA RECURRENCE

2023· article· en· W4385584393 sur OpenAlexaff
Chirayu Chokshi, Vaseem Shaikh, David Tieu, Benjamin Brakel, Kevin R. Brown, Katherine Chan, Martín A. Rossotti, William Maich, Chitra Venugopal, Alisha Anand, John S. Lazo, Thomas Kislinger, Jian Lü, John Provias, Kevin A. Henry, Jason Moffat, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchBiologyDownregulation and upregulationAxon guidanceMedulloblastomaReceptorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Resistance to genotoxic therapies and tumor recurrence are hallmarks of glioblastoma (GBM), an aggressive brain tumor. Here, we explore the functional drivers of post-treatment recurrent GBM. By conducting genome-wide CRISPR-Cas9 screens in patient-derived GBM models, we uncover distinct genetic dependencies in recurrent tumor cells that were absent in their patient-matched primary predecessors, accompanied by increased mutational burden and differential transcript and protein expression. These analyses map a multilayered genetic response to drive tumor recurrence, identifying protein tyrosine phosphatase 4A2 (PTP4A2) as a novel modulator of self-renewal, proliferation and tumorigenicity at GBM recurrence. Mechanistically, genetic perturbation or small molecule inhibition of PTP4A2 represses axon guidance activity through a dephosphorylation axis with roundabout guidance receptor 1 (ROBO1), exploiting a functional dependency on ROBO signaling. Roundabout guidance receptor 1 (ROBO1) protein is involved in axonal guidance during neurodevelopment and aberrant ROBO1 signaling axis is associated with higher tumorigenicity in GBM. ROBO1 was highly expressed on the surface of malignant and treatment-refractory brain tumor initiating cells (BTICs) in rGBM, brain metastasis (BM) and medulloblastoma (MB). Importantly, engineered anti-ROBO1 single-domain antibodies also mimic the effects of PTP4A2 inhibition. We therefore developed and validated second-generation CAR-T cells against ROBO1, which demonstrated upregulation of activation markers, enhanced cytokine release, markedly increased proliferation, and induction of potent and specific tumor cell death compared to untransduced cells in all the three brain cancers. These findings were further validated in vivo in rGBM, MB and BM models, where ROBO1 CAR-T cells showed significant reduction in tumor burden and increase in survival of treated mice. We conclude that functional reprogramming drives tumorigenicity and dependence on a multi-targetable PTP4A2-ROBO1 signaling axis at GBM recurrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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