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Enregistrement W4385658427 · doi:10.1089/scd.2023.0038

Fate Specification of GFAP-Negative Primitive Neural Stem Cells and Their Progeny at Clonal Resolution

2023· article· en· W4385658427 sur OpenAlexaff
Samantha Z. Yammine, Ian Burns, Jessica Gosio, Andrew Peluso, Daniel M. Merritt, Brendan T. Innes, Brenda L.K. Coles, Wen Rui Yan, Gary D. Bader, Cindi M. Morshead, Derek van der Kooy

Notice bibliographique

RevueStem Cells and Development · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNeural stem cellProgenitor cellNeurosphereProgenitorStem cellEmbryonic stem cellCell biologyLineage (genetic)Glial fibrillary acidic proteinPopulationPrecursor cellImmunologyAdult stem cellGeneticsCellGeneImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mature brain contains an incredible number and diversity of cells that are produced and maintained by heterogeneous pools of neural stem cells (NSCs). Two distinct types of NSCs exist in the developing and adult mouse brain: Glial Fibrillary Acidic Protein (GFAP)-negative primitive (p)NSCs and downstream GFAP-positive definitive (d)NSCs. To better understand the embryonic functions of NSCs, we performed clonal lineage tracing within neurospheres grown from either pNSCs or dNSCs to enrich for their most immediate downstream neural progenitor cells (NPCs). These clonal progenitor lineage tracing data allowed us to construct a hierarchy of progenitor subtypes downstream of pNSCs and dNSCs that were then validated using single-cell transcriptomics. Further, we identify Nexn as required for neuronal specification from neuron/astrocyte progenitor cells downstream of rare pNSCs. Combined, these data provide single-cell resolution of NPC lineages downstream of rare pNSCs that likely would be missed from population-level analyses in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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