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Enregistrement W4385665137 · doi:10.3389/fpls.2023.1233666

An oligosaccharyltransferase from Leishmania donovani increases the N-glycan occupancy on plant-produced IgG1

2023· article· en· W4385665137 sur OpenAlexaff
Gernot Beihammer, Julia König-Beihammer, Benjamin Kogelmann, Valentina Ruocco, Clemens Grünwald‐Gruber, Marc‐André D’Aoust, Pierre‐Olivier Lavoie, Pooja Saxena, Johannes S. Gach, Herta Steinkellner, Richard Strasser

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTransgenic Plants and Applications
Établissements canadiensMedicago (Canada)
Organismes subventionnairesSchool of Medicine, Duke UniversityNational Institutes of HealthBundesministerium für Digitalisierung und WirtschaftsstandortÖsterreichische ForschungsförderungsgesellschaftNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesEQUIPMENT BOKU VIENNA INSTITUTE OF BIOTECHNOLOGYStandortagentur TirolUniversität für Bodenkultur WienAustrian Science FundAmt der NÖ Landesregierung
Mots-clésGlycanOccupancyLeishmania donovaniBiologyLeishmaniaLeishmaniasisImmunologyGlycoproteinEcologyBiochemistryVisceral leishmaniasisParasite hostingComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N-Glycosylation of immunoglobulin G1 (IgG1) at the heavy chain Fc domain (Asn297) plays an important role for antibody structure and effector functions. While numerous recombinant IgG1 antibodies have been successfully expressed in plants, they frequently display a considerable amount (up to 50%) of unglycosylated Fc domain. To overcome this limitation, we tested a single-subunit oligosaccharyltransferase from the protozoan Leishmania donovani (LdOST) for its ability to improve IgG1 Fc glycosylation. LdOST fused to a fluorescent protein was transiently expressed in Nicotiana benthamiana and confocal microscopy confirmed the subcellular location at the endoplasmic reticulum. Transient co-expression of LdOST with two different IgG1 antibodies resulted in a significant increase (up to 97%) of Fc glycosylation while leaving the overall N-glycan composition unmodified, as determined by different mass spectrometry approaches. While biochemical and functional features of “glycosylation improved” antibodies remained unchanged, a slight increase in FcγRIIIa binding and thermal stability was observed. Collectively, our results reveal that LdOST expression is suitable to reduce the heterogeneity of plant-produced antibodies and can contribute to improving their stability and effector functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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