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Enregistrement W4385694287 · doi:10.1016/j.celrep.2023.112942

Zika-specific neutralizing antibodies targeting inter-dimer envelope epitopes

2023· article· en· W4385694287 sur OpenAlexfundno aff
Rajeshwer S. Sankhala, Vincent Dussupt, Gina Donofrio, Gregory D. Gromowski, Rafael A. De La Barrera, Rafael A. Larocca, Letzibeth Mendez-Rivera, Anna Lee, Misook Choe, Weam I. Zaky, Grace Mantus, Jaime L. Jensen, Wei‐Hung Chen, Neelakshi Gohain, Hongjun Bai, Michael K. McCracken, Rosemarie D. Mason, David J. Leggat, Bonnie M. Slike, Ursula Tran, Ningbo Jian, Peter Abbink, Rebecca Peterson, Érica Araújo Mendes, Rafael Freitas de Oliveira França, Guilherme Amaral Calvet, Ana María Bispo de Filippis, Adrian B. McDermott, Mario Roederer, Mayda Hernandez, Amie Albertus, Edgar Davidson, Benjamin J. Doranz, Morgane Rolland, Merlin L. Robb, Rebecca M. Lynch, Dan H. Barouch, Richard G. Jarman, Stephen J. Thomas, Kayvon Modjarrad, Nelson L. Michael, Shelly J. Krebs, Michael Joyce

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWalter Reed Army Institute of ResearchBiological and Environmental ResearchDefense Health AgencyNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesBasic Energy SciencesOffice of ScienceNational Institutes of HealthNational Research Council CanadaUniversity of ChicagoHenry M. Jackson FoundationBrookhaven National LaboratoryArgonne National LaboratoryU.S. Department of EnergyU.S. Department of Defense
Mots-clésEpitopeVirologyZika virusMonoclonal antibodyAntibodyBiologyAntigenicityAntigenGlycoproteinEpitope mappingVirusImmunologyMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zika virus (ZIKV) is an emerging pathogen that causes devastating congenital defects. The overlapping epidemiology and immunologic cross-reactivity between ZIKV and dengue virus (DENV) pose complex challenges to vaccine design, given the potential for antibody-dependent enhancement of disease. Therefore, classification of ZIKV-specific antibody targets is of notable value. From a ZIKV-infected rhesus macaque, we identify ZIKV-reactive B cells and isolate potent neutralizing monoclonal antibodies (mAbs) with no cross-reactivity to DENV. We group these mAbs into four distinct antigenic groups targeting ZIKV-specific cross-protomer epitopes on the envelope glycoprotein. Co-crystal structures of representative mAbs in complex with ZIKV envelope glycoprotein reveal envelope-dimer epitope and unique dimer-dimer epitope targeting. All four specificities are serologically identified in convalescent humans following ZIKV infection, and representative mAbs from all four groups protect against ZIKV replication in mice. These results provide key insights into ZIKV-specific antigenicity and have implications for ZIKV vaccine, diagnostic, and therapeutic development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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