Deciphering the differential expression patterns of yield-related negative regulators in hexaploid wheat and F1 hybrids at different growth stages
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Being a major source of protein and calories in the human diet, bread wheat is cultivated worldwide, and its yield is showing dwindling notion due to various environmental challenges. Hexaploid bread wheat underwent a series of polyploidization events through interspecific hybridizations that conferred adaptive plasticity and resulted in duplication and neofunctionalization of major agronomic genes. Interestingly the genetic architecture of polyploid wheat not only confers adaptive plasticity but also offers huge genetic diversity. However, the contribution of different gene copies (homeologs) encoded from different subgenomes (A, B, D) at different growth stages remained unexplored. In this study, we assessed the differential expression profiles of yield-related negative regulators in elite cultivars of wheat and their F1 hybrids and identified various cis-regulatory signatures that might influence these expression patterns. Furthermore, the differential and preferential expression patterns of the homeologs showed dynamic expression profiles of A, B, and D subgenomes at six different growth stages, portraying the different homeolog-dominance at the same stage in the different cultivars and their F1 hybrids. Based on the expression profiling, hybrid progenies of elite cultivars were developed that showed better heterosis such as up to 17% increase in the average number of grains and up to 50% increase in average thousand grains weight as compared to mid-parents and the F2 segregating populations demonstrated varying yields from high-yielding parents. These results suggest the significance of dynamic transcriptional expression patterns and the regulatory signatures of major genes that can substantially contribute and provide insights for the selective introduction of better cultivars into hybrid breeding programs which can be harnessed for the improvement of future wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».