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Enregistrement W4385754569 · doi:10.14745/ccdr.v49i78a03

A Burkholderia stabilis outbreak associated with the use of ultrasound gel in multiple healthcare centres in Montréal, Canada, May–October 2021

2023· article· en· W4385754569 sur OpenAlexaffvenueabout
Christine Arsenault, Josée Harel, Florence Doualla‐Bell, Yiorgos Alexandros Cavayas, Xavier Marchand-Senécal, Charles Frenette, Yves Longtin, Linda Lalande, L Marie-Paule Diby, Nadia Desmarais

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurkholderia infections and melioidosis
Établissements canadiensJewish General HospitalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalMcGill University Health CentreHôpital Maisonneuve-RosemontHôpital du Sacré-Cœur de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOutbreakMultilocus sequence typingTypingPulsed-field gel electrophoresisBurkholderia cepacia complexGel electrophoresisMicrobiologyMedicineBiologyBacteriaBurkholderiaGeneticsGenotypeVirologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Burkholderia stabilis is a non-fermenting, gram-negative bacteria that has previously been implicated in multiple nosocomial outbreaks through the use of contaminated medical devices and substances.This article reports on an outbreak of B. stabilis infections and colonizations, involving 11 patients from five acute care hospitals in Montréal, Canada.Methods: One sample was not available for testing, but the remaining 10 isolates (91%) were sent for phylogenetic testing.Medical materials and the patients' environments were also sampled and cultured.Samples were tested using pulsed field gel electrophoresis and multilocus sequence typing.Results: The outbreak was found to be associated with the use of intrinsically contaminated non-sterile ultrasound gel.Relatedness of the gel's and the patients' B. stabilis strains was demonstrated using gel electrophoresis and multilocus sequence typing analyses.The investigation was concluded with a prompt recall of the product, and the outbreak was declared over by the end of October 2021.Conclusion: Contaminated non-sterile gel caused infections and pseudo-infections in several patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,140

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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