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Enregistrement W4385779963 · doi:10.1038/s42003-023-05191-5

Delivered complementation in planta (DCIP) enables measurement of peptide-mediated protein delivery efficiency in plants

2023· article· en· W4385779963 sur OpenAlexfundno aff
Jeffrey Wang, Henry Squire, Natalie S. Goh, Heyuan Michael Ni, Edward Lien, Cerise Wong, Eduardo González‐Grandío, Markita P. Landry

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Defense Science and Engineering GraduateDivision of Chemical, Bioengineering, Environmental, and Transport SystemsAgricultural Research ServiceOffice of ScienceGordon and Betty Moore FoundationFoundation for Food and Agriculture ResearchU.S. Department of AgricultureAlfred P. Sloan FoundationUniversity of California BerkeleyCamille and Henry Dreyfus FoundationNational Science FoundationNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesPhilomathia FoundationU.S. Department of EnergyU.S. Department of Defense
Mots-clésNicotiana benthamianaBimolecular fluorescence complementationmCherryComplementationProtein-fragment complementation assayRecombinant DNACell-penetrating peptideArabidopsisCytosolPeptideCell biologyLuciferaseBiologyBiochemistryTransfectionGreen fluorescent proteinYeastEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using a fluorescence complementation assay, Delivered Complementation in Planta (DCIP), we demonstrate cell-penetrating peptide-mediated cytosolic delivery of peptides and recombinant proteins in Nicotiana benthamiana. We show that DCIP enables quantitative measurement of protein delivery efficiency and enables functional screening of cell-penetrating peptides for in-planta protein delivery. Finally, we demonstrate that DCIP detects cell-penetrating peptide-mediated delivery of recombinantly expressed proteins such as mCherry and Lifeact into intact leaves. We also demonstrate delivery of a recombinant plant transcription factor, WUSCHEL (AtWUS), into N. benthamiana. RT-qPCR analysis of AtWUS delivery in Arabidopsis seedlings also suggests delivered WUS can recapitulate transcriptional changes induced by overexpression of AtWUS. Taken together, our findings demonstrate that DCIP offers a new and powerful tool for interrogating cytosolic delivery of proteins in plants and highlights future avenues for engineering plant physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,944
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,166
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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