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Enregistrement W4385802385 · doi:10.1136/jmg-2022-109030

Further delineation of the rare GDACCF (global developmental delay, absent or hypoplastic corpus callosum, dysmorphic facies syndrome): genotype and phenotype of 22 patients with <i>ZNF148</i> mutations

2023· article· en· W4385802385 sur OpenAlexaff
Katalin Szakszon, Charles Marques Lourenço, Bert Callewaert, David Geneviève, Flavien Rouxel, Denis Morin, Anne‐Sophie Denommé‐Pichon, Antonio Vitobello, Wesley G Patterson, Raymond J. Louie, Filippo Pinto e Vairo, Eric W. Klee, Charu Kaiwar, Ralitza H. Gavrilova, Katherine Agre, Sébastien Jacquemont, Jizi Khadijé, Jacques C. Giltay, Koen L.I. van Gassen, Gabriella Merő, Erica H. Gerkes, Bregje W.M. van Bon, Tuula Rinne, Rolph Pfundt, Han G. Brunner, Oana Caluseriu, Ute Grasshoff, Martin Kehrer, Tobias B. Haack, Melik Malek Khelifa, Anke K. Bergmann, Anna M. Cueto‐González, Ariadna Campos Martorell, Shwetha Ramachandrappa, L. Sawyer, P Fasel, Dominique Braun, Isis Atallah, Andrea Superti‐Furga, Vanda McNiven, David Chitayat, Syed Anas Ahmed, Heiko Brennenstuhl, Eva MC Schwaibolf, Gladys Battisti, Benoît Parmentier, Servi J.C. Stevens

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFetal and Pediatric Neurological Disorders
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of TorontoUniversity Health NetworkUniversity of AlbertaUniversité de MontréalMount Sinai HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCorpus callosumPhenotypeGlobal developmental delayGeneticsBiologyGenotypeMutationGenotype-phenotype distinctionGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Pathogenic variants in the zinc finger protein coding genes are rare causes of intellectual disability and congenital malformations. Mutations in the ZNF148 gene causing GDACCF syndrome (global developmental delay, absent or hypoplastic corpus callosum, dysmorphic facies; MIM #617260) have been reported in five individuals so far. Methods As a result of an international collaboration using GeneMatcher Phenome Central Repository and personal communications, here we describe the clinical and molecular genetic characteristics of 22 previously unreported individuals. Results The core clinical phenotype is characterised by developmental delay particularly in the domain of speech development, postnatal growth retardation, microcephaly and facial dysmorphism. Corpus callosum abnormalities appear less frequently than suggested by previous observations. The identified mutations concerned nonsense or frameshift variants that were mainly located in the last exon of the ZNF148 gene. Heterozygous deletion including the entire ZNF148 gene was found in only one case. Most mutations occurred de novo, but were inherited from an affected parent in two families. Conclusion The GDACCF syndrome is clinically diverse, and a genotype-first approach, that is, exome sequencing is recommended for establishing a genetic diagnosis rather than a phenotype-first approach. However, the syndrome may be suspected based on some recurrent, recognisable features. Corpus callosum anomalies were not as constant as previously suggested, we therefore recommend to replace the term ‘GDACCF syndrome’ with ‘ ZNF148 -related neurodevelopmental disorder’.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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