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Enregistrement W4385810247 · doi:10.1038/s41598-023-37644-6

Machine learning-based prediction of longitudinal cognitive decline in early Parkinson’s disease using multimodal features

2023· article· en· W4385810247 sur OpenAlexafffundabout
Hannes Almgren, Milton Camacho, Alexandru Hanganu, Mekale Kibreab, Richard Camicioli, Zahinoor Ismail, Nils D. Forkert, Oury Monchi

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalWomen and Children’s Health Research InstituteInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalUniversity of AlbertaUniversité de MontréalCégep Marie-VictorinUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesInstitut de Valorisation des DonnéesCanadian Institutes of Health ResearchParkinson CanadaCanada Research ChairsConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchParkinson Québec
Mots-clésDiseaseParkinson's diseaseCognitive declineCognitionComputer scienceMachine learningArtificial intelligenceData scienceDementiaMedicineNeurosciencePsychologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Patients with Parkinson’s Disease (PD) often suffer from cognitive decline. Accurate prediction of cognitive decline is essential for early treatment of at-risk patients. The aim of this study was to develop and evaluate a multimodal machine learning model for the prediction of continuous cognitive decline in patients with early PD. We included 213 PD patients from the Parkinson’s Progression Markers Initiative (PPMI) database. Machine learning was used to predict change in Montreal Cognitive Assessment (MoCA) score using the difference between baseline and 4-years follow-up data as outcome. Input features were categorized into four sets: clinical test scores, cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers, brain volumes, and genetic variants. All combinations of input feature sets were added to a basic model, which consisted of demographics and baseline cognition. An iterative scheme using RReliefF-based feature ranking and support vector regression in combination with tenfold cross validation was used to determine the optimal number of predictive features and to evaluate model performance for each combination of input feature sets. Our best performing model consisted of a combination of the basic model, clinical test scores and CSF-based biomarkers. This model had 12 features, which included baseline cognition, CSF phosphorylated tau, CSF total tau, CSF amyloid-beta1-42, geriatric depression scale (GDS) scores, and anxiety scores. Interestingly, many of the predictive features in our model have previously been associated with Alzheimer’s disease, showing the importance of assessing Alzheimer’s disease pathology in patients with Parkinson’s disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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