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Enregistrement W4385858843 · doi:10.1093/ofid/ofad436

Schrödinger's Cat Paradox: <i>Bartonella</i> Serology Cannot Be Used to Speciate <i>Bartonella</i> Endocarditis

2023· article· en· W4385858843 sur OpenAlexaff
Carl Boodman, Nitin Gupta

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBartonella species infections research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBartonellaSerologyEndocarditisBartonella henselaeVirologyMedicineMicrobiologyCat-scratch diseaseBiologyImmunologyPathologyDiseaseInternal medicineAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We read with great interest Ordaya et al.'s recent article titled "Let the Cat out of the Heart", describing the clinical characteristics of 16 cases of Bartonella endocarditis.We congratulate the authors on an intriguing case series that highlights Bartonella endocarditis's association with renal failure, embolization and PR3-ANCA positivity.Publishing case-level data on Bartonella endocarditis is increasingly relevant in light of the 2023 updates to the Modified Duke criteria that include Bartonella diagnostics as a major endocarditis criterion.[1]However, we have concerns that the article, including the witty title, may mislead readers to consider B. henselae as the predominant etiology of Bartonella endocarditis without providing species-level evidence to support this claim.The 16 cases described were diagnosed by Bartonella serologic positivity, with seven patients confirmed to Bartonella genus-level by Bartonella PCR on explanted cardiac tissue.Species-specific PCR targets such as 16S rRNA, ribC, rpoB and gltA genes were not performed.[2]While the authors mention Bartonella species other than B. henselae in the introduction, they proceed to focus on B. henselae, emphasizing cat exposure and Ctenocephalides flea vectors."Cat exposure" was reported in 62.5% of the described cases, but the authors failed to define what this exposure meant.Were all "cat exposures" scratches or simply a recollection of a feline in the vicinity?The authors also failed

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,026

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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