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Enregistrement W4386018701 · doi:10.1016/j.foreco.2023.121370

Signs of rapid evolution in an invasive forest species: Drivers of the incipient neutral, adaptive and phenotypic divergence

2023· article· en· W4386018701 sur OpenAlexaff
Ramiro R. Ripa, Julissa Roncal, Yan B. Linhart, Jorgelina Franzese, Estela Raffaele, Andrea C. Premoli

Notice bibliographique

RevueForest Ecology and Management · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRange (aeronautics)Genetic diversityGenetic driftInbreeding depressionPinus radiataInvasive speciesEcologyGenetic divergenceSelection (genetic algorithm)Evolutionary biologyPopulationInbreedingGenetic variationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evolutionary forces such as genetic drift and natural selection operate during the process of biological invasion. More specifically, nonnative populations suffer genetic and demographic bottlenecks, and are exposed to new environmental, climatic and biotic filters. Thus, neutral and/or adaptive drivers may contribute to genetic differentiation of the introduced germplasm. We hypothesize that the gene pool of fire-adapted species that become invasive in fire-prone ecosystems may differ from that of originally planted and native one because of novel selective forces and founder effects. Genetic impoverishment due to genetic drift could also be buffered by demographic processes as the production of a large aerial seed bank by serotiny. We conducted genomic analyses of the world’s most planted tree Pinus radiata using Single Nucleotide Polymorphisms, comparing introduced cohorts with and without fire exposure, and also with one population of the native range. Phenotypic traits of introduced cohorts were assessed for quantitative characters. In the introduced range we found lower expected heterozygosity and nucleotide diversity due to bottlenecks during introduction and commercial selection in orchards. We also detected decreased inbreeding, related to a serotinous seed bank that buffers bottlenecks. We found genomic regions under selection, both in the comparison between native and introduced range, and between introduced cohorts with and without exposure to fire. Within the introduced area, we observed possible fire-mediated diversifying selection for five quantitative traits. Our results show that both neutral and adaptive forces promote early divergence of the introduced species Pinus radiata . Also, fire acts as a rapid selection factor, prompting the incipient adaptive divergence of cohorts recruited after fires, facilitating invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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