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Enregistrement W4386021375 · doi:10.1101/2023.08.18.23294172

Infection rate and Immune Response to SARS-CoV-2 in Canadian Retail Workers -Cohort Description

2023· preprint· en· W4386021375 sur OpenAlexafffundabout
Mathieu Thériault, Kim Santerre, Nicholas Brousseau, Samuel Rochette, Joelle N. Pelletier, Caroline Gilbert, Jean‐François Masson, Mariana Baz, Denis Boudreau, Sylvie Trottier

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalRegroupement Québécois sur les Matériaux de PointeCentre hospitalier universitaire de QuébecInstitut National de Santé Publique du QuébecUniversité de MontréalUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université LavalPROTEO
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésCohortMedicineVaccinationIncidence (geometry)Cohort studyPandemicSocioeconomic statusDemographyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Prospective cohort studyGerontologyEnvironmental healthFamily medicineImmunologyInternal medicinePopulationDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Retail workers are an understudied occupational group that may have been at increased risk of contracting SARS-CoV-2 during the COVID-19 pandemic. To explore this question, we set up a longitudinal cohort of participants working in this sector to document the rate of SARS-CoV-2 infection and the immune response to infection and/or vaccination. A total of 304 participants were recruited between April 20 th , 2021 and October 22 nd , 2021. They were invited to attend three visits (each separated by ∼12 weeks) during which they provided blood samples. Information was collected on participant characteristics, SARS-CoV-2 detection tests done, COVID-19 symptoms, and vaccination. An extension phase of two additional visits was carried out between March 15 th , 2022 and October 3 rd , 2022 to document the impact of the Omicron variant among the 198 participants who were still eligible for recruitment. Participants were aged 18 to 75 and worked in grocery stores, hardware stores, bars or restaurants within the Québec City metropolitan area (Canada). Findings to date: This article describes participants’ demographic, socioeconomic, behavioral, occupational and clinical characteristics, and their COVID-19 symptoms (when applicable), as well as SARS-CoV-2 vaccination status and any SARS-CoV-2 positive diagnostic test (i.e., PCR or rapid antigen) from the beginning of the pandemic until the last visit. The goals of this study were: to assess the rate of SARS-CoV-2 infection, and the immune response (innate and acquired) to SARS-CoV-2 infection or vaccination using a variety of techniques. The humoral immune response was measured by reference and experimental enzyme-linked immunosorbent assays, as well as microneutralization assays with live viruses and experimental pseudoneutralization with an angiotensin-converting enzyme 2-spike assay. Cellular immune response was evaluated by using the viral analog R848 to activate peripheral blood mononuclear cells and neutrophils.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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