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Enregistrement W4386054853 · doi:10.1101/2023.08.21.553868

NYUS.2: an Automated Machine Learning Prediction Model for the Large-scale Real-time Simulation of Grapevine Freezing Tolerance in North America

2023· preprint· en· W4386054853 sur OpenAlexaff
Hongrui Wang, Gaurav D. Moghe, Alisson P. Kovaleski, Markus Keller, Timothy E. Martinson, A. Harrison Wright, Jeffrey L. Franklin, Andréanne Hébert-Haché, Caroline Provost, Michael D. Reinke, Amaya Atucha, Michael G. North, Pierre Helwi, Michela Centinari, Jason P. Londo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensSonaca (Canada)Agriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesOffice of the Vice Chancellor for Research and Graduate Education, University of Wisconsin-MadisonNational Institute of Food and AgricultureAgricultural Research ServiceWisconsin Alumni Research Foundation
Mots-clésDormancyScale (ratio)Feature (linguistics)Machine learningClimate modelComputer scienceArtificial intelligenceClimate changeGeographyCartographyHorticultureEcologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Accurate and real-time monitoring of grapevine freezing tolerance is crucial for the sustainability of the grape industry in cool climate viticultural regions. However, on-site data is limited. Current prediction models underperform under diverse climate conditions, which limits the large-scale deployment of these methods. We combined grapevine freezing tolerance data from multiple regions in North America and generated a predictive model based on hourly temperature-derived features and cultivar features using AutoGluon, an automatic machine learning engine. Feature importance was quantified by AutoGluon and SHAP value. The final model was evaluated and compared with previous models for its performance under different climate conditions. The final model achieved an overall 1.36 °C root-mean-square error during model testing and outperformed two previous models using three test cultivars at all testing regions. Two feature importance quantification methods identified five shared essential features. Detailed analysis of the features indicates that the model might have adequately extracted some biological mechanisms during training. The final model, named NYUS.2, was deployed along with two previous models as an R shiny-based application in the 2022-2023 dormancy season, enabling large-scale and real-time simulation of grapevine freezing tolerance in North America for the first time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,543
Score d'incertitude au seuil0,576

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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