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Enregistrement W4386065665 · doi:10.1371/journal.ppat.1011572

Variation among strains of Borrelia burgdorferi in host tissue abundance and lifetime transmission determine the population strain structure in nature

2023· article· en· W4386065665 sur OpenAlexafffund
Christopher B. Zinck, Prasobh Raveendram Thampy, Eva‐Maria Uhlemann, Hesham Adam, Jenny Wachter, Danae M. Suchan, Andrew D. S. Cameron, Ryan O. M. Rego, Dustin Brisson, Catherine Bouchard, Nicholas H. Ogden, Maarten J. Voordouw

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of ReginaUniversité de MontréalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesFondation canadienne de la maladie de LymeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Health Research FoundationPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaUniversity of Saskatchewan
Mots-clésBorrelia burgdorferiBiologyStrain (injury)Host (biology)Transmission (telecommunications)Abundance (ecology)PopulationBorreliaGeneticsEcologyAntibodyMedicineEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogen life history theory assumes a positive relationship between pathogen load in host tissues and pathogen transmission. Empirical evidence for this relationship is surprisingly rare due to the difficulty of measuring transmission for many pathogens. The comparative method, where a common host is experimentally infected with a set of pathogen strains, is a powerful approach for investigating the relationships between pathogen load and transmission. The validity of such experimental estimates of strain-specific transmission is greatly enhanced if they can predict the pathogen population strain structure in nature. Borrelia burgdorferi is a multi-strain, tick-borne spirochete that causes Lyme disease in North America. This study used 11 field-collected strains of B. burgdorferi, a rodent host (Mus musculus, C3H/HeJ) and its tick vector (Ixodes scapularis) to determine the relationship between pathogen load in host tissues and lifetime host-to-tick transmission (HTT). Mice were experimentally infected via tick bite with 1 of 11 strains. Lifetime HTT was measured by infesting mice with I. scapularis larval ticks on 3 separate occasions. The prevalence and abundance of the strains in the mouse tissues and the ticks were determined by qPCR. We used published databases to obtain estimates of the frequencies of these strains in wild I. scapularis tick populations. Spirochete loads in ticks and lifetime HTT varied significantly among the 11 strains of B. burgdorferi. Strains with higher spirochete loads in the host tissues were more likely to infect feeding larval ticks, which molted into nymphal ticks that had a higher probability of B. burgdorferi infection (i.e., higher HTT). Our laboratory-based estimates of lifetime HTT were predictive of the frequencies of these strains in wild I. scapularis populations. For B. burgdorferi, the strains that establish high abundance in host tissues and that have high lifetime transmission are the strains that are most common in nature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,829
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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