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Enregistrement W4386142014 · doi:10.3390/cancers15174229

ARID1B Immunohistochemistry Is an Important Test for the Diagnosis of Dedifferentiated and Undifferentiated Gynecologic Malignancies

2023· article· en· W4386142014 sur OpenAlexaff
Basile Tessier‐Cloutier

Notice bibliographique

RevueCancers · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCA4SMARCB1ImmunohistochemistryTargeted therapyMedicinePathologyBiologyCancer researchOncologyBioinformaticsInternal medicineCancerGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dedifferentiated and undifferentiated endometrial and ovarian carcinomas (DDC/UDC) are aggressive malignancies defined by morphologic and molecular undifferentiation, and associated with core SWI/SNF deficiency. Their main differential diagnoses include high-grade endometrial and ovarian carcinomas that often show overlapping morphologic and molecular profiles. Loss of cell lineage markers expression by immunohistochemistry (IHC) is commonly used to assist diagnosis, but it has poor specificity, while core SWI/SNF deficiency is much more specific. Approximately half of SWI/SNF-deficient DDC/UDC are associated with loss of ARID1B expression, yet, unlike the other core SWI/SNF proteins (SMARCA4 and SMARCB1), this test is rarely available, even in tertiary centers. Mutational testing for ARID1B is increasingly common among targeted DNA sequencing panels, but it is difficult to interpret in the absence of IHC results. Overall, the importance of including ARID1B IHC as part of the routine panel for undifferentiated gynecologic malignancies should be emphasized, especially as SWI/SNF inactivation is becoming a necessary biomarker for diagnostics, clinical management, and clinical trial enrollment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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