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Enregistrement W4386245000 · doi:10.1101/2023.08.28.554882

Characterizing Subcortical Structural Heterogeneity in Autism

2023· preprint· en· W4386245000 sur OpenAlexafffund
David N. MacDonald, Saashi A. Bedford, Emily Olafson, Min Tae M Park, Gabriel A. Devenyi, Stéphanie Tullo, Raihaan Patel, Evdokia Anagnostou, Simon Baron‐Cohen, Edward T. Bullmore, Lindsay R. Chura, Michael Craig, Christine Ecker, Dorothea L. Floris, Rosemary Holt, Rhoshel Lenroot, Jason P. Lerch, Michael Lombardo, Declan Murphy, Armin Raznahan, Amber Ruigrok, Elizabeth Smith, Russell T. Shinohara, Michael D. Spencer, John Suckling, Margot J. Taylor, Audrey Thurm, Meng‐Chuan Lai, M. Mallar Chakravarty

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthHospital for Sick ChildrenHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalSickKids FoundationUniversity of TorontoMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilNational Institutes of HealthKing's College LondonCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchCanada First Research Excellence FundGovernment of OntarioSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustMcGill University
Mots-clésGlobus pallidusThalamusStriatumAutismNeurosciencePsychologyNeuroimagingVentral striatumAutism spectrum disorderBiologyBasal gangliaDopamineCentral nervous systemDevelopmental psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autism presents with significant phenotypic and neuroanatomical heterogeneity, and neuroimaging studies of the thalamus, globus pallidus and striatum in autism have produced inconsistent and contradictory results. These structures are critical mediators of functions known to be atypical in autism, including sensory gating and motor function. We examined both volumetric and fine-grained localized shape differences in autism using a large ( n =3145, 1045-1318 after strict quality control), cross-sectional dataset of T1-weighted structural MRI scans from 32 sites, including both males and females (assigned-at-birth). We investigated three potentially important sources of neuroanatomical heterogeneity: sex, age, and intelligence quotient (IQ), using a meta-analytic technique after strict quality control to minimize non-biological sources of variation. We observed no volumetric differences in the thalamus, globus pallidus, or striatum in autism. Rather, we identified a variety of localized shape differences in all three structures. Including age, but not sex or IQ, in the statistical model improved the fit for both the pallidum and striatum, but not for the thalamus. Age-centered shape analysis indicated a variety of age-dependent regional differences. Overall, our findings help confirm that the neurodevelopment of the striatum, globus pallidus and thalamus are atypical in autism, in a subtle location-dependent manner that is not reflected in overall structure volumes, and that is highly non-uniform across the lifespan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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