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Enregistrement W4386255358 · doi:10.1186/s12014-023-09418-9

Cerebrospinal fluid camk2a levels at baseline predict long-term progression in multiple sclerosis

2023· article· en· W4386255358 sur OpenAlexaff
Dorsa Sohaei, Simon Thebault, Lisa Avery, Ihor Batruch, K. H. Brian Lam, Wei Xu, Rubah S. Saadeh, Isobel A. Scarisbrick, Eleftherios P. Diamandis, Ioannis Prassas, Mark S. Freedman

Notice bibliographique

RevueClinical Proteomics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreOttawa HospitalPublic Health OntarioUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultiple sclerosisMedicineCerebrospinal fluidDiseaseBiomarkerInternal medicineOncologyBiomarker discoveryBioinformaticsProteomicsImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Multiple sclerosis (MS) remains a highly unpredictable disease. Many hope that fluid biomarkers may contribute to better stratification of disease, aiding the personalisation of treatment decisions, ultimately improving patient outcomes. OBJECTIVE: The objective of this study was to evaluate the predictive value of CSF brain-specific proteins from early in the disease course of MS on long term clinical outcomes. METHODS: In this study, 34 MS patients had their CSF collected and stored within 5 years of disease onset and were then followed clinically for at least 15 years. CSF concentrations of 64 brain-specific proteins were analyzed in the 34 patient CSF, as well as 19 age and sex-matched controls, using a targeted liquid-chromatography tandem mass spectrometry approach. RESULTS: We identified six CSF brain-specific proteins that significantly differentiated MS from controls (p < 0.05) and nine proteins that could predict disease course over the next decade. CAMK2A emerged as a biomarker candidate that could discriminate between MS and controls and could predict long-term disease progression. CONCLUSION: Targeted approaches to identify and quantify biomarkers associated with MS in the CSF may inform on long term MS outcomes. CAMK2A may be one of several candidates, warranting further exploration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,286
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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