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Enregistrement W4386279645 · doi:10.1126/scitranslmed.abo1557

A blood-based marker of mitochondrial DNA damage in Parkinson’s disease

2023· article· en· W4386279645 sur OpenAlexaff
Rui Qi, Esther Sammler, Claudia P. González-Hunt, Ivana Barraza, Nicholas Pena, Jeremy P. Rouanet, Yahaira Naaldijk, Steven D. Goodson, Fabio Blandini, Kirk I. Erickson, Andrea M. Weinstein, Michael W. Lutz, John B. Kwok, Glenda M. Halliday, Nicolas Dzamko, Shalini Padmanabhan, Roy N. Alcalay, Cheryl Waters, Penelope Hogarth, Tanya Simuni, Danielle Smith, Connie Marras, Francesca Tonelli, Dario R. Alessi, Andrew B. West, Sruti Shiva, Sabine Hilfiker, Laurie H. Sanders

Notice bibliographique

RevueScience Translational Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institutes of HealthNational Institute on AgingUK Research and InnovationMedical Research CouncilBiogenNational Health and Medical Research CouncilParkinson's FoundationUniversity of PittsburghNational Institute of Neurological Disorders and StrokeSanofiMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésMitochondrial DNALRRK2DNA damageBiologyNeuroprotectionDiseaseParkinson's diseaseMitochondrionPathogenesisMutationMolecular biologyPathologyMedicineGeneticsImmunologyGeneDNANeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parkinson’s disease (PD) is the most common neurodegenerative movement disorder, and neuroprotective or disease-modifying interventions remain elusive. High-throughput markers aimed at stratifying patients on the basis of shared etiology are required to ensure the success of disease-modifying therapies in clinical trials. Mitochondrial dysfunction plays a prominent role in the pathogenesis of PD. Previously, we found brain region–specific accumulation of mitochondrial DNA (mtDNA) damage in PD neuronal culture and animal models, as well as in human PD postmortem brain tissue. To investigate mtDNA damage as a potential blood-based marker for PD, we describe herein a PCR-based assay (Mito DNA DX ) that allows for the accurate real-time quantification of mtDNA damage in a scalable platform. We found that mtDNA damage was increased in peripheral blood mononuclear cells derived from patients with idiopathic PD and those harboring the PD-associated leucine-rich repeat kinase 2 ( LRRK2 ) G2019S mutation in comparison with age-matched controls. In addition, mtDNA damage was elevated in non–disease-manifesting LRRK2 mutation carriers, demonstrating that mtDNA damage can occur irrespective of a PD diagnosis. We further established that Lrrk2 G2019S knock-in mice displayed increased mtDNA damage, whereas Lrrk2 knockout mice showed fewer mtDNA lesions in the ventral midbrain, compared with wild-type control mice. Furthermore, a small-molecule kinase inhibitor of LRRK2 mitigated mtDNA damage in a rotenone PD rat midbrain neuron model and in idiopathic PD patient–derived lymphoblastoid cell lines. Quantifying mtDNA damage using the Mito DNA DX assay may have utility as a candidate marker of PD and for measuring the pharmacodynamic response to LRRK2 kinase inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,569

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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