352. GENERATION OF PATIENT-DERIVED ESOPHAGEAL ADENOCARCINOMA ORGANOIDS FROM CIRCULATING TUMOR CELLS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Esophageal adenocarcinoma (EAC) is diagnosed in nearly 40% of patients when their cancer has already metastasized. Circulating tumor cells (CTCs) play a critical role in the metastatic cascade and need to be investigated in the context of EAC, but these must be expanded due to their scarcity in blood. Organoid models have been shown to recapitulate tumor heterogeneity and in vivo drug sensitivity. Thus, we aim to generate and characterize CTC-derived organoids from EAC patients. Methods CTCs were isolated from 32 blood samples obtained from 13 EAC patients using two methods: (1) Ficoll-based density gradient centrifugation followed by CD45+ cell depletion using magnetic-activated cell sorting (MACS) and/or (2) immunodensity separation using the RosetteSep CTC Enrichment Cocktail (Stemcell Technologies). Isolated CTCs were embedded and grown in Matrigel domes. Cultures were dissociated into single cells which were magnetically labelled and captured on a microfluidic chip. The captured cells were stained with DAPI, anti-CD45, anti-CK11, anti-CK13, and anti-CK18 antibodies. These cells were then visualized and quantified using fluorescence microscopy. Results Organoids were generated from twenty-one out of thirty-two samples, after two to six weeks in culture, with an average of 20.76 ± 6.435 organoids per sample. These EAC CTC derived organoids underwent a growth arrest once they reached an arbitrary size but were able to regenerate upon dissociation and re-seeding. However, no increase in the size or number of organoids was observed post-passaging. Of the nine CTC-derived organoid samples characterized using microfluidic capture and immunostaining, all nine had the presence of CD45 negative, CK positive, and DAPI positive cells. Conclusion In this study, we validated commonly used CTC isolation methods and were able to demonstrate that CTCs isolated can be cultured to generate organoids. Additional investigation is required to overcome the growth arrest which occurs during culture.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».