MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4386357430 · doi:10.32920/24076302

Synthesis of a Novel Symmetrical Photocleavable Group for the Efficient Capture and Release of Cysteine Sulfenic Acids on Oxidized Proteins From Streptavidin Beads

2023· preprint· en· W4386357430 sur OpenAlexaff
Thershan Satkunarajah

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueClick Chemistry and Applications
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSulfenic acidChemistryAzideStreptavidinCysteineBiotinReactivity (psychology)Combinatorial chemistryBiotinylationThiolPhotochemistryStereochemistryBiochemistryOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cysteine sulfenic acids are thought to be key intermediates in protein oxidation but are difficult to study due to their high reactivity and transient nature. The beneficial properties of these oxidative events have been underexplored due to earlier studies primarily focusing on cell damage and death; however, increasing evidence suggests various physiological processes rely on these oxidative modifications. Previous work has shown that bicyclo[6.1.0]non-4-ynes (BCNs) can label sulfenic acids with high reaction kinetics via a pericyclic reaction, while also enabling copper-free click chemistry, allowing for a biotin-azide tag to be installed. However, due to the strong biotin- streptavidin interaction, these probes suffer from poor protein recovery and sub-optimal performance during mass-spectrometric analysis, respectively. Efforts towards incorporating the BCNs into a novel symmetrical photocleavable group based on 1,4-naphthoquinone, or their use in combination with photocleavable biotin-azide are proposed to improve upon these limitations and are presented in this thesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetClick Chemistry and ApplicationsTravaux en français237 207