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Enregistrement W4386366374 · doi:10.1016/j.jbc.2023.105213

Porcine IKKε is involved in the STING-induced type I IFN antiviral response of the cytosolic DNA signaling pathway

2023· article· en· W4386366374 sur OpenAlexaff
Jia Luo, Qi Cao, Jiajia Zhang, Sen Jiang, Nengwen Xia, Shaohua Sun, Wanglong Zheng, Nanhua Chen, François Meurens, Jianzhong Zhu

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesHigher Education Discipline Innovation ProjectPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésIκB kinaseTANK-binding kinase 1StingCell biologyInnate immune systemInterferonKinaseBiologySignal transductionStimulator of interferon genesNF-κBProtein kinase AImmune systemVirologyMAP kinase kinase kinaseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cyclic GMP–AMP synthase and stimulator of interferon (IFN) genes (cGAS–STING) pathway serves as a crucial component of innate immune defense and exerts immense antiviral activity by inducing the expression of type I IFNs. Currently, STING-activated production of type I IFNs has been thought to be mediated only by TANK-binding kinase 1 (TBK1). Here, we identified that porcine IKKε (pIKKε) is also directly involved in STING-induced type I IFN expression and antiviral response by using IKKε −/− porcine macrophages. Similar to pTBK1, pIKKε interacts directly with pSTING on the C-terminal tail. Furthermore, the TBK1-binding motif of pSTING C-terminal tail is essential for its interaction with pIKKε, and within the TBK1-binding motif, the leucine (L) 373 is also critical for the interaction. On the other hand, both kinase domain and scaffold dimerization domain of pIKKε participate in the interactions with pSTING. Consistently, the reconstitution of pIKKε and its mutants in IKKε −/− porcine macrophages corroborated that IKKε and its kinase domain and scaffold dimerization domain are all involved in the STING signaling and antiviral function. Thus, our findings deepen the understanding of porcine cGAS–STING pathway, which lays a foundation for effective antiviral therapeutics against porcine viral diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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