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Enregistrement W4386399752 · doi:10.1016/j.bone.2023.116893

A multi-stack registration technique to improve measurement accuracy and precision across longitudinal HR-pQCT scans

2023· article· en· W4386399752 sur OpenAlexfundno aff
Danielle E. Whittier, Matthias Walle, Denis Schenk, Penny R. Atkins, Caitlyn J. Collins, Philippe K. Zysset, Kurt Lippuner, Ralph Müller

Notice bibliographique

RevueBone · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and osteoporosis research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsHorizon 2020Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Commission
Mots-clésStack (abstract data type)Quantitative computed tomographyReproducibilityImage registrationComputer scienceRADIUSBiomedical engineeringNuclear medicineArtificial intelligenceMedicineBone densityImage (mathematics)MathematicsOsteoporosisStatisticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent applications of high-resolution peripheral quantitative computed tomography (HR-pQCT) have demonstrated that changes in local bone remodelling can be quantified in vivo using longitudinal three-dimensional image registration. However, certain emerging applications, such as fracture healing and joint analysis, require larger multi-stack scan regions that can result in stack shift image artifacts. These artifacts can be detrimental to the accurate alignment of the bone structure across multiple timepoints. The purpose of this study was to establish a multi-stack registration protocol for evaluating longitudinal HR-pQCT images and to assess the accuracy and precision error in comparison with measures obtained using previously established three-dimensional longitudinal registration. METHODS: Three same day multi-stack HR-pQCT scans of the radius (2 stacks in length) and tibia (3 stacks in length) were obtained from 39 healthy individuals who participated in a previous reproducibility study. A fully automated multi-stack registration algorithm was developed to re-align stacks within a scan by leveraging slight offsets between longitudinal scans. Stack shift severity before and after registration was quantified using a newly proposed stack-shift severity score. The false discovery rate for bone remodelling events and precision error of bone morphology and micro-finite element analysis parameters were compared between longitudinally registered scans with and without the addition of multi-stack registration. RESULTS: Most scans (82 %) improved in stack alignment or maintained the lowest stack shift severity score when multi-stack registration was implemented. The false discovery rate of bone remodelling events significantly decreased after multi-stack registration, resulting in median false detection of bone formation and resorption fractions between 3.2 to 7.5 % at the radius and 3.4 to 5.3 % at the tibia. Further, precision error was significantly reduced or remained unchanged in all standard bone morphology and micro-finite element analysis parameters, except for total and trabecular cross-sectional areas. CONCLUSION: Multi-stack registration is an effective strategy for accurately aligning multi-stack HR-pQCT scans without modification of the image acquisition protocol. The algorithm presented here is a viable approach for performing accurate morphological analysis on multi-stack HR-pQCT scans, particularly for advanced application investigating local bone remodelling in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,070

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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