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Enregistrement W4386422263 · doi:10.1515/bot-2023-0031

An overview of fungal taxonomic, functional, and genetic diversity in coastal and oceanic biomes in megadiverse Mexico

2023· article· en· W4386422263 sur OpenAlexaff
Julio Horacio Villegas Olguín, Patricia Vélez, Vivianne Solís‐Weiss, Alejandra Barrios, Allison K. Walker, Guadalupe Ponce-Vélez, María C. González, Mario Figueroa, Alfonso V. Botello

Notice bibliographique

RevueBotanica Marina · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAcadia University
Organismes subventionnairesDivision of Ocean SciencesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoDirectorate for Biological SciencesUniversidad Nacional Autónoma de México
Mots-clésBiomeEcologyHydrothermal ventDeep seaGeographyTaxonOceanographyBiologyGeologyEcosystemPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A comprehensive literature review of mycodiversity in sandy beaches and oceanic environments in Mexico is presented through the analysis of published works from 1949 to early 2023. In addition, four unexplored sandy beaches in the Pacific Ocean and Gulf of California were sampled in order to fill knowledge gaps in terms of sampling biases. Marine fungi of Mexico were reported from water column, sediment, and debris samples collected in sandy beaches, open ocean, deep-sea plains, hydrothermal vents, and oxygen minimum zones in the Gulf of Mexico, the Pacific Ocean, the Gulf of California, and the Caribbean Sea. The taxonomic, functional, and genetic diversity, as well as distribution patterns and potential use of marine fungal genetic resources are discussed. A list of 126 species in 83 genera, 40 families, 25 orders, 12 classes, three phyla and one subphylum (excluding non-cultured taxa) of marine fungi is documented from Mexico. Lastly, we identified areas that would benefit from additional research, including the exploration of further deep-sea biomes in the Pacific Ocean, and coastal areas covering ecoregions in the states of Sonora, Sinaloa, Nayarit, Michoacán, and Oaxaca.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0120,010
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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