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Enregistrement W4386537729 · doi:10.1093/neuonc/noad137.449

P21.07.B THE LHSC/WESTERN BRAIN TUMOUR TISSUE BANK: A GLOBAL RESOURCE

2023· article· en· W4386537729 sur OpenAlexaff
Joseph Megyesi, Rui Wang, Morris F. White, Adrianna Ranger, David A. Ramsay, Q Zhang

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTissue bankBrain tissueMedicinePathologyTumour tissueInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract BACKGROUND A brain tumour tissue bank can serve as an important source of tissue for neuro-oncology research. The London Health Sciences (LHSC) / Western Brain Tumour Tissue Bank (BTTB) provides high-quality brain tumour tissue specimens that are used globally for neuro-oncology research. The LHSC / Western BTTB was established approximately 35 years ago. The objectives of this study were to: 1) establish an up-to-date accounting of the brain tumour specimens in the BTTB; 2) compare the quality control measures used to assess specimen quality against those used in other comparable tissue banks; 3) determine the scope of tissue distribution globally. MATERIAL AND METHODS The records of the BTTB were reviewed with the assistance of the BTTB coordinator. Number and type of brain tumour specimens were recorded. The quality control measures used in the BTTB were compared with the published literature. The location of laboratories to which brain tumour tissue had been distributed was determined. RESULTS Since 1995 there have been 1536 adult brain tumour specimens collected in the BTTB. There are approximately 3 vials per case, not including paraffin blocks. This includes 713 primary intra-axial central nervous system tumours, 229 meningeal tumours, and 285 metastatic tumours. Since 1995 there have been 223 pediatric brain tumour specimens collected in the BTTB. This includes 53 pilocytic astrocytomas, 32 medulloblastomas, and 27 ependymomas. The quality control measures used in the BTTB appear to exceed those used by other brain tumour tissue banks as determined by literature review. The BTTB has sent tissue specimens to neuro-oncology laboratories around the globe and numerous publications have resulted from experiments using the brain tumour tissue supplied by the BTTB. CONCLUSION The LHSC / Western BTTB has collected a large and diverse number of high quality brain tumour specimens since its founding. It serves as a global resource, and the supplied tissue has led to many research publications in neuro-oncology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil0,917

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2740,230

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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