The oral pathogen <i>Porphyromonas gingivalis</i> resists the antimicrobial peptide LGL13K and evades the D-enantiomer by synonymous mutations in <i>hagA</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Porphyromonas gingivalis is a keystone pathogen for periodontal disease. The bacteria are black-pigmented and require heme for growth. P. gingivalis exhibit resistance to many antimicrobial peptides, including the L-enantiomer of the antimicrobial peptide GL13K, which contributes to their success in the oral cavity. P. gingivalis W50 was resistant to LGL13K but susceptible to the stereo-isomer DGL13K. Upon prolonged exposure to DGL13K, a novel non-pigmented mutant was isolated that showed a low minimum inhibitory concentration and two-fold extended minimum duration for killing by DGL13K, consistent with tolerance to this peptide. The DGL13K tolerant bacteria exhibited synonymous mutations in the hagA gene. The mutations did not prevent mRNA expression but were predicted to alter mRNA structure. The non-pigmented bacteria were deficient in hemagglutination and hemoglobin binding, suggesting that the HagA protein was not expressed. This was supported by whole cell ELISA and gingipain activity assays, which suggested the absence of HagA but not two closely related gingipains. In vivo virulence was similar for wild-type and non-pigmented bacteria in the Galleria mellonella model. Loss of the hemagglutinin HagA may allow bacteria to escape from a biofilm that is under attack by antimicrobial peptides.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».