Uncovering a mammalian neural-specific poly(A) binding protein with unique properties
Notice bibliographique
Résumé
The mRNA 3' poly(A) tail plays a critical role in regulating both mRNA translation and turnover. It is bound by the cytoplasmic poly(A) binding protein (PABPC), an evolutionarily conserved protein that can interact with translation factors and mRNA decay machineries to regulate gene expression. Mammalian PABPC1, the prototypical PABPC, is expressed in most tissues and interacts with eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) to stimulate translation in specific contexts. In this study, we uncovered a new mammalian PABPC, which we named neural PABP (neuPABP), as it is predominantly expressed in the brain. neuPABP maintains a unique architecture as compared with other PABPCs, containing only two RNA recognition motifs (RRMs) and maintaining a unique N-terminal domain of unknown function. neuPABP expression is activated in neurons as they mature during synaptogenesis, where neuPABP localizes to the soma and postsynaptic densities. neuPABP interacts with the noncoding RNA BC1, as well as mRNAs coding for ribosomal and mitochondrial proteins. However, in contrast to PABPC1, neuPABP does not associate with actively translating mRNAs in the brain. In keeping with this, we show that neuPABP has evolved such that it does not bind eIF4G and as a result fails to support protein synthesis in vitro. Taken together, these results indicate that mammals have expanded their PABPC repertoire in the brain and propose that neuPABP may support the translational repression of select mRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».