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Enregistrement W4386703138 · doi:10.1101/2023.09.12.557383

Mouse models for pancreatic ductal adenocarcinoma are affected by the cre-driver used to promote KRAS <sup>G12D</sup> activation

2023· preprint· en· W4386703138 sur OpenAlexafffund
Fatemeh Mousavi, Joyce K. Thompson, Justine Lau, Nur M. Renollet, Mickenzie B. Martin, Jake McGue, Timothy L. Frankel, Parisa Shooshtari, Christopher L. Pin, Filip Bednar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensWestern UniversityChildren’s Health Research InstituteLawson Health Research InstituteOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesMitacsCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésKRASCre recombinaseHaploinsufficiencyCancer researchPancreatic Intraepithelial NeoplasiaPancreatic cancerBiologyAcinar cellCarcinogenesisPancreasTamoxifenGenetically modified mousePancreatic tumorTransgeneCancerGeneMutationEndocrinologyPhenotypeGeneticsBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The fundamental biology of pancreatic ductal adenocarcinoma has been greatly impacted by the characterization of genetically modified mouse models that allow temporal and spatial activation of oncogenic KRAS (KRAS G12D ). The most commonly used model involves targeted insertion of a cre recombinase into the Ptf1a gene. However, this approach disrupts the Ptf1a gene, resulting in haploinsufficiency that likely affects sensitivity to oncogenic KRAS ( KRAS G12D ). The goal of this study was to determine if Ptf1a haploinsufficiency affected the acinar cell response to KRAS G12D before and after induction of pancreatic injury. We performed morphological and molecular analysis of three mouse lines that express a tamoxifen-inducible cre recombinase to activate KRAS G12D in acinar cells of the pancreas. The cre-recombinase was targeted to the acinar-specific transcription factor genes, Ptf1a and Mist1/Bhlha15 , or expressed within a BAC-derived Elastase transgene. Up to two months after tamoxifen induction of KRAS G12D , morphological changes were negligible. However, induction of pancreatic injury by cerulein resulted in stark differences in tissue morphology between lines within seven days, which were maintained for at least five weeks after injury. Ptf1a creERT pancreata showed widespread PanIN lesions and fibrosis, while the Mist1 creERT and Ela-creERT models showed reduced amounts of pre-neoplastic lesions. RNA-seq analysis prior to inducing injury suggested Ptf1a creERT and Mist1 creERT lines have unique profiles of gene expression that predict a differential response to injury. Multiplex analysis of pancreatic tissue confirmed different inflammatory responses between the lines. These findings suggest understanding the mechanisms underlying the differential response to KRAS G12D will help in further defining the intrinsic KRAS-driven mechanisms of neoplasia initiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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