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Enregistrement W4386709864 · doi:10.1038/s41467-023-41427-y

Genetically encoded discovery of perfluoroaryl macrocycles that bind to albumin and exhibit extended circulation in vivo

2023· article· en· W4386709864 sur OpenAlexafffund
Jeffrey Y. K. Wong, Arunika I. Ekanayake, Serhii Kharchenko, Steven E. Kirberger, Ryan Qiu, Payam Kelich, Susmita Sarkar, Jiaqian Li, Kleinberg X. Fernandez, Edgar R. Alvizo-Paez, J. Miao, Shiva Kalhor‐Monfared, J. Dwyer John, Hongsuk Kang, Hwanho Choi, John M. Nuss, John C. Vederas, Yu‐Shan Lin, Matthew S. Macauley, Lela Vuković, William C. K. Pomerantz, Ratmir Derda

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueApelin-related biomedical research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesFerring Research InstituteGovernment of CanadaNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIn vivoHuman serum albuminAlbuminPeptideChemistryCysteineBiochemistryApelinSerum albuminPlasma protein bindingBiologyReceptorEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Peptide-based therapeutics have gained attention as promising therapeutic modalities, however, their prevalent drawback is poor circulation half-life in vivo. In this paper, we report the selection of albumin-binding macrocyclic peptides from genetically encoded libraries of peptides modified by perfluoroaryl-cysteine S N Ar chemistry, with decafluoro-diphenylsulfone ( DFS ). Testing of the binding of the selected peptides to albumin identified SICRFFC as the lead sequence. We replaced DFS with isosteric pentafluorophenyl sulfide ( PFS ) and the PFS -SICRFFCGG exhibited K D = 4–6 µM towards human serum albumin. When injected in mice, the concentration of the PFS -SICRFFCGG in plasma was indistinguishable from the reference peptide, SA-21. More importantly, a conjugate of PFS -SICRFFCGG and peptide apelin-17 analogue (N 3 -PEG 6 -NMe17A2) showed retention in circulation similar to SA-21; in contrast, apelin-17 analogue was cleared from the circulation after 2 min. The PFS -SICRFFC is the smallest known peptide macrocycle with a significant affinity for human albumin and substantial in vivo circulation half-life. It is a productive starting point for future development of compact macrocycles with extended half-life in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,924
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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