Protein expression profiles in brain organoids are more similar to those in human brain parenchyma than in mouse brain parenchyma
Notice bibliographique
Résumé
Summary Human brain organoids are emerging as relevant models for the study of human brain health and disease. However, it has not been shown whether human brain organoids exhibit a proteoform profile similar to the human brain. Herein, we demonstrate that unguided brain organoids exhibit minimal batch-to-batch variability in cell composition and metabolism when generated from induced pluripotent stem cells (iPSCs) derived from male-female siblings. We then show that profiles of select proteins in these brain organoids are more similar to autopsied human cortical and cerebellar profiles than to those in mouse cortical samples. Brain organoids derived from sibling iPSCs do not exhibit any sex differences in protein proportions. By benchmarking human brain organoid proteoforms against human parenchymal tissue, we establish the foundation for future studies that could investigate, for example, how well brain organoids can model any of the known sex-dependent differences in cellular function, including responses of drug-receptor interactions. Highlights Brain organoids (BOs) display protein banding similar to human parenchymal lysates Protein banding differs between mouse and human brain parenchyma lysates Sibling-derived BOs have similar cell composition and metabolism at day 90 Sibling-derived BOs exhibit similar protein banding at day 90
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».