Abstract PO-070: New patient-derived head and neck cancer xenograft (PDX) panel for drug development, immuno-oncology and translational research
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) represent a heterogeneous group of epithelial cell malignancies arising from the upper aerodigestive tract. Despite of improved therapies, HNSCC remain a devastating disease. Oropharynx cancers are mainly attributed to infection with human papillomavirus (HPV). Since 2017, HNSCC are classified into HPV-negative and HPV-positive HNSCC. Therapies in the clinic are surgery and/or radiotherapy (RT)/radiochemotherapy (RCT) with a recurrence of about 50%. Therefore, new approaches are needed to improve long-term remission and patient survival. Recent advances in high-throughput molecular profiling have helped to identify genetic dispositions (TP53, FAT1, CDKNA2, NOTCH1 etc.) for HNSCC. We have generated and characterized a diverse panel (n = 85) of patient-derived xenografts (PDX) of HNSCC for preclinical research and immuno-oncological approaches. We successfully established 85 HNSCC PDX from fresh surgery tissue of primary and recurrent carcinomas by direct subcutaneous transplantation into immune-deficient mice. 14 HNSCC PDX were derived from HPV-positive tumors. We treated 28 HNSCC PDX with radiotherapy alone or radiochemotherapy. Heterogeneous individual responses to treatments resemble the clinical situation. For characterization, the established HNSCC PDX were treated with standard of cares (SoC) such as docetaxel, platinum compounds, cetuximab, 5-fluorouracil and investigational drugs. No correlation was observed to mutations and drug response. Molecular subtypes were determined based on gene expression data. Cetuximab response was associated with basal subtype and inflamed/mesenchymal subtype was negative predictive for cetuximab response. Further, 30 HNSCC PDX were analyzed for PD-L1 expression as suitable candidates for the evaluation of checkpoints inhibitors such as nivolumab and pembrolizumab and other novel immunotherapy approaches on humanized mice. To gain a deeper insight into the molecular biology, RNA sequencing was performed for 46 HNSCC models. Based on RNASeq data, an individual Human Leucocyte Antigen (HLA) profile of each PDX was determined and a comprehensive HLA matching analysis of the HNSCC models and 9 peripheral blood mononuclear cell (PBMC) donors was performed to enable personalized, preclinical immuno-oncology studies. Our newly and comprehensively characterized HNSCC PDX panel enables the evaluation of new targeted and immunological therapies in preclinical phase II studies. It provides an exceptional platform for the identification and validation of new targets and enables the preclinical screening of new combinations in translational research. Citation Format: Bernadette Brzezicha, Theresia Conrad, Maria Stecklum, Michael Becker, Konrad Klinghammer, Jens Hoffmann. New patient-derived head and neck cancer xenograft (PDX) panel for drug development, immuno-oncology and translational research [abstract]. In: Proceedings of the AACR-AHNS Head and Neck Cancer Conference: Innovating through Basic, Clinical, and Translational Research; 2023 Jul 7-8; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2023;29(18_Suppl):Abstract nr PO-070.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».