Abstract PO-047: A novel saliva miRNA panel of promising diagnostic biomarkers for oral cancer: The association of miR-21 with smoking history
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Tobacco use is implicated in the carcinogenesis of oral squamous cell carcinoma (OSCC), which is associated with poor survival if not diagnosed early. It is urgent to develop a novel non-invasive and highly sensitive risk assessment and diagnostic method to screen OSCC. Here, we explored salivary miRNAs as a screening method for OSCC in a high-risk group of patients, such as smokers. Materials and methods: Saliva was collected from 44 individuals (23 HPV-negative OSCC; 21 controls; an equal number of smokers and non-smokers). Twenty head and neck cancer-related miRNA markers were analyzed by qPCR, using dual-labeled probes (miR-20A, miR-21, miR-27B, miR-29A, miR-29B, miR-29C, miR-31, miR-34a, miR-99a, miR-125a, miR-136, miR-139, miR-155, miR-192, miR-200A, miR-375, miR-425A, miR-451a, miR-504, miR-3928; RNU6 control), and by Welch’s t-test and ROC (receiver operating characteristic) curve; GraphPad Prism 7.0. Results: A panel of 4 miRNA markers (miR-21, miR-136, miR-3928, miR-29B) was found to be significantly overexpressed in the saliva of OSCC versus healthy controls with a diagnostic ability (p<0.05 by Welch’s t-test; AUC (area under the ROC curve): 64-85%, sensitivity: 50-67%, specificity: 32-38%; 95% confidence interval; by ROC curve analysis). “Oncomir” miR-21 levels (miR-21/RNU6) were found to be significantly higher in the saliva of OSCC patients with a smoking history (mean ± SD: 0.17 ± 0.19) versus never-smokers (mean ± SD: 0.0056 ± 0.0075) (p<0.05; by t-test) with a diagnostic ability (AUC: 90%, sensitivity: 68%, specificity: 30%; 95% confidence interval). Conclusions: We provide a novel panel of non-invasive, easy-to-apply, and sensitive biomarkers, for the diagnosis of oral cancer, including miR-21 in individuals with a smoking history, encouraging their validation in a large group of head and neck cancer patients. Citation Format: Dimitra Vageli, Panagiotis G. Doukas, Benjamin L. Judson. A novel saliva miRNA panel of promising diagnostic biomarkers for oral cancer: The association of miR-21 with smoking history [abstract]. In: Proceedings of the AACR-AHNS Head and Neck Cancer Conference: Innovating through Basic, Clinical, and Translational Research; 2023 Jul 7-8; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2023;29(18_Suppl):Abstract nr PO-047.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».