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Enregistrement W4386784884 · doi:10.1158/1557-3265.aacrahns23-po-023

Abstract PO-023: The AP-1 transcription factor component, JunB, regulates the expression of HPV genes in head and neck cancer

2023· article· en· W4386784884 sur OpenAlexaboutno aff
Hina Rehmani, Natalia Isaeva, Travis P. Schrank, Wendell G. Yarbrough

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchHead and neck squamous-cell carcinomaMedicineCancerDemethylating agentOncologyHead and neck cancerInternal medicineBiologyDNA methylationGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Within head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC), those induced by the human papillomavirus (HPV+) have a more hypermethylated genome compared to those that are negative (HPV-). Therefore, our lab explored the usage of the demethylating agent 5-azacytidine (5-aza), an FDA-approved drug for the treatment of myelodysplasia and acute myeloid leukemia. Repurposing FDA-approved drugs is a strategic way to quickly provide patients with secondary therapeutic options, especially since the incidence of HPV+ HNSCC is now considered an epidemic in the US and Western Europe. Additionally, initial therapy for patients is aggressive leading to adverse, lifelong side effects. Despite having a higher cure rate than HPV-HNSCC, the recurrence rate is still approximately 30% for HPV+ HNSCC. Our lab has found that HPV+ HNSCC cells are more sensitive than HPV- cells to 5-aza as low doses of 5-aza delayed HPV+ xenograft tumor growth and 5-aza-treated HPV+ tumor samples from patients treated in a window trial had increased cell death. Despite demethylation inducing an active, open chromatin conformation, we also observed a marked downregulation of HPV genes expression after 5-aza. Decreased HPV E6 expression, followed by reactivation of tumor suppressor p53, induced p53-dependent apoptosis in HPV+ HNSCC. This decreased expression of HPV genes is an essential component of 5-aza-associated toxicity toward HPV+ HNSCC. Our lab has recently explored the molecular mechanisms of 5-aza on HPV+ HNSCC. We found that 5-aza transcriptionally downregulated the expression of HPV genes, including oncogenes E6 and E7. Microarray studies show marked downregulation of the proto-oncogene JunB, a component of the transcription factor AP-1 (Activator Protein 1) after 5-aza treatment. Experimental deletion of JunB inhibited oncogenes E6 and E7 and restored p53 but also indicated that untreated HPV+ HNSCCs depend on JunB for clonogenic growth. Through this study, we have identified a novel dependency on JunB in HPV+ HNSCC and revealed a new rational target that is desperately needed to treat recurrent/metastatic patients and decrease the toxicity associated with current treatment. Citation Format: Hina Rehmani, Natalia Isaeva, Travis P. Schrank, Wendell G. Yarbrough. The AP-1 transcription factor component, JunB, regulates the expression of HPV genes in head and neck cancer [abstract]. In: Proceedings of the AACR-AHNS Head and Neck Cancer Conference: Innovating through Basic, Clinical, and Translational Research; 2023 Jul 7-8; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2023;29(18_Suppl):Abstract nr PO-023.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,236
Tête enseignante GPT0,493
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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